More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2617 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  100 
 
 		 172 aa  343  7e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  87.5 
 
 		 181 aa  296  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  65.09 
 
 		 172 aa  221  4e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  60 
 
 		 171 aa  207  7e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  58.54 
 
 		 196 aa  191  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  49.08 
 
 		 420 aa  142  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  46 
 
 		 156 aa  135  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  42.6 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  43.2 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  43.2 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  43.2 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  46.63 
 
 		 415 aa  131  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  42.94 
 
 		 184 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  40.36 
 
 		 408 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  43.2 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  42.94 
 
 		 412 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  43.2 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  42.33 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  41.42 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  41.42 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  41.42 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  42.01 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  41.18 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  39.76 
 
 		 408 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  45.68 
 
 		 417 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  41.42 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  41.42 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  41.42 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  41.42 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  46.84 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  44.83 
 
 		 413 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  51.02 
 
 		 408 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  46.45 
 
 		 168 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  51.02 
 
 		 408 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  45.57 
 
 		 173 aa  127  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  44.1 
 
 		 166 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.5 
 
 		 431 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  54.69 
 
 		 413 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  45.68 
 
 		 437 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  44.87 
 
 		 413 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  46.58 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  40.24 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  40.83 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  44.44 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  41.18 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  50.34 
 
 		 410 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  43.75 
 
 		 413 aa  124  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  43.03 
 
 		 166 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  46.95 
 
 		 413 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  47.8 
 
 		 414 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  45.68 
 
 		 432 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  42.95 
 
 		 415 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  44.59 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  47.8 
 
 		 414 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.64 
 
 		 430 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  41.62 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  45.7 
 
 		 419 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  41.62 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  41.62 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  41.62 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3262  CinA-like  42.33 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  48.63 
 
 		 416 aa  121  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  46.45 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  43.71 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  41.76 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  42.24 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  47.17 
 
 		 421 aa  120  9e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  48.98 
 
 		 408 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  38.46 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  42.76 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  41.04 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  45.16 
 
 		 420 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  43.03 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  45.73 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  52.89 
 
 		 418 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  46.26 
 
 		 424 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  44.91 
 
 		 417 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  39.52 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  43.75 
 
 		 411 aa  119  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  42.95 
 
 		 430 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  45.03 
 
 		 412 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  43.95 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  43.03 
 
 		 416 aa  119  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  45.73 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  50.83 
 
 		 419 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  40.12 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  40.12 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  40.12 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  43.05 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  39.74 
 
 		 164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  40.12 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  40.12 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  40.12 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  42.42 
 
 		 416 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  40.12 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  40.96 
 
 		 184 aa  117  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  43.42 
 
 		 419 aa  117  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  42.42 
 
 		 416 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  40.12 
 
 		 165 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  40.96 
 
 		 162 aa  117  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>