More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2959 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  100 
 
 		 171 aa  331  3e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  76.05 
 
 		 172 aa  251  5.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  60 
 
 		 172 aa  207  7e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  61.18 
 
 		 181 aa  206  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  62.58 
 
 		 196 aa  180  9.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  45.75 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  48.17 
 
 		 420 aa  141  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  51.28 
 
 		 413 aa  136  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  56.67 
 
 		 429 aa  135  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  44.87 
 
 		 417 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  45.96 
 
 		 415 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  48.95 
 
 		 416 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  44.38 
 
 		 416 aa  128  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  42.24 
 
 		 412 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  41.61 
 
 		 412 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  43.71 
 
 		 411 aa  124  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  44.74 
 
 		 412 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  43.29 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  44.23 
 
 		 420 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  47.59 
 
 		 218 aa  123  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  46.91 
 
 		 416 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  40.96 
 
 		 425 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  46.91 
 
 		 416 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  46.31 
 
 		 424 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  41.52 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  42.07 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  42.07 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  42.07 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  42.07 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  42.07 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  40.35 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  42.07 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  41.52 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  41.52 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  42.07 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  40.94 
 
 		 166 aa  121  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  40.65 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  42.76 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  40.94 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  41.46 
 
 		 413 aa  120  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  43.79 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  40.94 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  40.67 
 
 		 413 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  40.13 
 
 		 408 aa  119  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  37.95 
 
 		 408 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  43.79 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  43.79 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  43.79 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  43.56 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  45.86 
 
 		 418 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  37.95 
 
 		 408 aa  118  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  42.33 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  42.33 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  42.33 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  42.33 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  42.33 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  44.9 
 
 		 432 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  44.52 
 
 		 421 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  42.33 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  42.33 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  49.63 
 
 		 408 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  43.8 
 
 		 413 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  42.33 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  40.65 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  42.31 
 
 		 400 aa  117  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  37.11 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  39.47 
 
 		 415 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  42.94 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  42.94 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  42.94 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  42.94 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  44.65 
 
 		 413 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  37.95 
 
 		 415 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  48.23 
 
 		 431 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  43.62 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1656  CinA domain-containing protein  46.1 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  43.56 
 
 		 418 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.12 
 
 		 431 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  44.23 
 
 		 413 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  49.62 
 
 		 408 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  40.61 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  51.54 
 
 		 410 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  42.14 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  46.58 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  51.28 
 
 		 417 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  40.76 
 
 		 419 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  52.85 
 
 		 437 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  38.56 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  48.89 
 
 		 408 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  41.88 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  43.4 
 
 		 414 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  43.04 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  43.64 
 
 		 423 aa  114  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  38.56 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  42.77 
 
 		 424 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  44.44 
 
 		 414 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  41.98 
 
 		 413 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  38.65 
 
 		 166 aa  114  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  38.12 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  40.65 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>