More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1563 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  100 
 
 		 196 aa  378  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  58.54 
 
 		 172 aa  191  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  61.11 
 
 		 172 aa  188  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  57.86 
 
 		 181 aa  181  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  62.58 
 
 		 171 aa  180  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  49.68 
 
 		 218 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  49.08 
 
 		 420 aa  135  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  45.78 
 
 		 413 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  42.6 
 
 		 413 aa  131  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  44.1 
 
 		 168 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  46.34 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  45.14 
 
 		 421 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  47.06 
 
 		 415 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  44.9 
 
 		 164 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  44.07 
 
 		 425 aa  128  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  47.59 
 
 		 418 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  45.03 
 
 		 420 aa  128  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  44.23 
 
 		 156 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  44.1 
 
 		 165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  45.14 
 
 		 418 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  44.17 
 
 		 160 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  46.2 
 
 		 413 aa  125  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  42.28 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  51.91 
 
 		 416 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  45.7 
 
 		 424 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  46.05 
 
 		 429 aa  125  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  42.17 
 
 		 166 aa  125  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  45.06 
 
 		 420 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  45 
 
 		 165 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  45 
 
 		 165 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  45 
 
 		 165 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  45 
 
 		 165 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  45 
 
 		 165 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  47.68 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  44.52 
 
 		 160 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  45 
 
 		 165 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  44.08 
 
 		 413 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  45 
 
 		 165 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  45.73 
 
 		 414 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  44.31 
 
 		 161 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  43.37 
 
 		 165 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  47.02 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  46.95 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  44.16 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  43.43 
 
 		 416 aa  122  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  46.15 
 
 		 437 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  46.25 
 
 		 414 aa  121  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  42.68 
 
 		 165 aa  121  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  45 
 
 		 431 aa  121  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1522  hypothetical protein  46.41 
 
 		 168 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  46.63 
 
 		 413 aa  121  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  44.52 
 
 		 165 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  44.52 
 
 		 165 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  44.52 
 
 		 165 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  41.18 
 
 		 415 aa  120  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  44.44 
 
 		 418 aa  120  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  42.26 
 
 		 411 aa  120  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  48.43 
 
 		 413 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  43.59 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  42.14 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  43.83 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  45.1 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3262  CinA-like  41.98 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  43.87 
 
 		 165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  48.47 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  45.1 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  43.87 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  53.28 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  45.1 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  39.18 
 
 		 415 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  43.53 
 
 		 417 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  44.03 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  45.45 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  41.32 
 
 		 166 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0067  competence/damage inducible protein CinA  41.94 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  53.85 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  40.49 
 
 		 412 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  44.17 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  44.17 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0055  CinA domain-containing protein  41.94 
 
 		 162 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  52.42 
 
 		 208 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  39.88 
 
 		 412 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  46.15 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  42.86 
 
 		 172 aa  117  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  42.5 
 
 		 169 aa  117  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  40.85 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  54.7 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  40.23 
 
 		 417 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  48 
 
 		 419 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  37.58 
 
 		 166 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  52.07 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  52.38 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  42.94 
 
 		 423 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17520  hypothetical protein  44.44 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  45.57 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  42.95 
 
 		 165 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  40.96 
 
 		 423 aa  116  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  41.57 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  43.12 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  50.68 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>