More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2467 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  100 
 
 		 172 aa  338  1e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  76.05 
 
 		 171 aa  251  5.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  65.09 
 
 		 172 aa  221  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  62.5 
 
 		 181 aa  211  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  61.11 
 
 		 196 aa  188  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  52.44 
 
 		 420 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  49.67 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  47.85 
 
 		 429 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  45.51 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  45.51 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  45.51 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  45.51 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  45.51 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  45.51 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  45.51 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  47.85 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  45.51 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  43.11 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  44.91 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  42.42 
 
 		 413 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  44.91 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  44.91 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  44.91 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  44.91 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  46.91 
 
 		 415 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  58.2 
 
 		 413 aa  128  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  52.85 
 
 		 417 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  44.31 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  43.04 
 
 		 164 aa  127  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  42.77 
 
 		 160 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  49.03 
 
 		 437 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  44.67 
 
 		 415 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  45.39 
 
 		 432 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  46.63 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  49.66 
 
 		 424 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  47.02 
 
 		 420 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  44.87 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  47.74 
 
 		 421 aa  124  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  46.01 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  50.74 
 
 		 416 aa  124  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  44.79 
 
 		 418 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  48.08 
 
 		 416 aa  124  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  41.94 
 
 		 160 aa  124  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  46.41 
 
 		 184 aa  124  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  41.4 
 
 		 412 aa  124  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  42.41 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  46.41 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  46.41 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  40.76 
 
 		 412 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  46.5 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  47.17 
 
 		 431 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  45.22 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  42.33 
 
 		 408 aa  122  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  45.4 
 
 		 423 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  54.87 
 
 		 425 aa  121  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  48.55 
 
 		 412 aa  121  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  46.79 
 
 		 165 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  45.86 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  44.94 
 
 		 400 aa  120  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  43.11 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  45.86 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  45.86 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  46.53 
 
 		 420 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  44.59 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  44.59 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  42.86 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  41.72 
 
 		 408 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  43.4 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  41.57 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  44.59 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  41.57 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  42.51 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1656  CinA domain-containing protein  46.1 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  42.51 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  42.51 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  42.51 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  42.51 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  47.33 
 
 		 408 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  44.94 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  42.51 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  42.51 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  46.67 
 
 		 408 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  39.1 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  53.98 
 
 		 418 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  43.4 
 
 		 413 aa  117  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  53.98 
 
 		 416 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  44.52 
 
 		 411 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  42.42 
 
 		 179 aa  117  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  40.49 
 
 		 423 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  53.98 
 
 		 416 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  43.12 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  47.58 
 
 		 418 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  39.62 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  42.94 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  43.06 
 
 		 413 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  44.1 
 
 		 371 aa  115  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  43.67 
 
 		 414 aa  115  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  44.38 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  54.17 
 
 		 430 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  50.89 
 
 		 430 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>