More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3733 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3733  CinA domain-containing protein  100 
 
 
166 aa  333  5.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000115453 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  57.72 
 
 
166 aa  160  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  52.17 
 
 
218 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  52.87 
 
 
164 aa  150  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  52.83 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  51.92 
 
 
162 aa  144  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  51.97 
 
 
160 aa  143  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  49.03 
 
 
159 aa  141  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0067  competence/damage inducible protein CinA  48.15 
 
 
162 aa  141  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0055  CinA domain-containing protein  48.15 
 
 
162 aa  140  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  47.5 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  47.5 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  47.5 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  47.5 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  47.5 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  47.5 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  47.5 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  50 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  49.34 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  44.16 
 
 
156 aa  138  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  48.67 
 
 
415 aa  138  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  47.5 
 
 
165 aa  138  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  49.33 
 
 
179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  46.88 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  46.88 
 
 
165 aa  137  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1704  CinA domain protein  46.47 
 
 
200 aa  137  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  49.06 
 
 
161 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  46.25 
 
 
165 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  47.77 
 
 
415 aa  136  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  46.91 
 
 
168 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  46.25 
 
 
165 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  46.25 
 
 
165 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1628  CinA domain-containing protein  48.1 
 
 
160 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  48.03 
 
 
162 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  46.88 
 
 
163 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  48 
 
 
165 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  45.51 
 
 
413 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  50.65 
 
 
165 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  48.43 
 
 
166 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  48.43 
 
 
160 aa  134  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1230  CinA domain-containing protein  48.1 
 
 
160 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000125807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  45.62 
 
 
165 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4031  CinA domain-containing protein  46.2 
 
 
160 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  44.03 
 
 
165 aa  133  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  42.86 
 
 
408 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  47.47 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17520  hypothetical protein  48.77 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1522  hypothetical protein  47.53 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  45.96 
 
 
164 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  43.2 
 
 
169 aa  132  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  42.86 
 
 
408 aa  132  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  46.26 
 
 
413 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  46.58 
 
 
414 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  45.34 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  45.27 
 
 
168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  50 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  46.45 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  44.44 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38570  CinA-related protein  47.53 
 
 
164 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  44.65 
 
 
168 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  45.68 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  41.82 
 
 
165 aa  127  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  42.41 
 
 
165 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  45.33 
 
 
412 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  45.28 
 
 
165 aa  127  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  46.75 
 
 
169 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  45.34 
 
 
168 aa  127  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1377  CinA, C-terminal  45.34 
 
 
192 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.368331  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1174  CinA-like  44.52 
 
 
177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  43.84 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  45.03 
 
 
413 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  41.57 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  45.89 
 
 
413 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  46.36 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  45.34 
 
 
173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  41.21 
 
 
165 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  44.67 
 
 
412 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  44.03 
 
 
160 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  41.57 
 
 
166 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  48.03 
 
 
166 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  45.7 
 
 
413 aa  124  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  45.7 
 
 
160 aa  124  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4034  cinA domain protein  45.62 
 
 
166 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.344001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  45.03 
 
 
415 aa  123  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0622  CinA-like protein  45.81 
 
 
174 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.550403  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  51.03 
 
 
371 aa  123  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  40.96 
 
 
166 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  45.64 
 
 
175 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  45.03 
 
 
179 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  45.64 
 
 
184 aa  122  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  45.64 
 
 
162 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  45.64 
 
 
162 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  48.48 
 
 
414 aa  121  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  42.21 
 
 
203 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0076  CinA-like  48.99 
 
 
167 aa  121  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  45.21 
 
 
414 aa  121  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  43.33 
 
 
156 aa  121  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  44.08 
 
 
164 aa  121  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  45.03 
 
 
418 aa  121  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  43.97 
 
 
419 aa  121  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>