More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2130 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  100 
 
 		 168 aa  337  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1615  CinA domain protein  65.64 
 
 		 166 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  65.64 
 
 		 166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  65.84 
 
 		 165 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  59.24 
 
 		 163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  59.73 
 
 		 162 aa  167  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  54.09 
 
 		 208 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  57.24 
 
 		 203 aa  164  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  54.09 
 
 		 211 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  53.12 
 
 		 208 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  52.5 
 
 		 206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  59.09 
 
 		 165 aa  160  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  59.09 
 
 		 165 aa  160  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  52.83 
 
 		 208 aa  160  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  55 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  53.46 
 
 		 202 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  52.5 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  53.7 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  56.94 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  53.64 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  54.42 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  50.67 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  46.25 
 
 		 163 aa  147  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  52.56 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0243  CinA domain-containing protein  50.31 
 
 		 178 aa  141  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.912222  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  51.27 
 
 		 203 aa  140  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  47.85 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  51.95 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  53.06 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  53.55 
 
 		 159 aa  137  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  51.7 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  48.7 
 
 		 414 aa  135  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  52.32 
 
 		 162 aa  133  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1422  CinA domain-containing protein  43.75 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  48.73 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  45.16 
 
 		 411 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  45.62 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  46.1 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  49.29 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  57.04 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  49.29 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2173  CinA domain-containing protein  59.29 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19979  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  49.29 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  48.34 
 
 		 413 aa  128  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  60.38 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  48.15 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  44.83 
 
 		 419 aa  127  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  50.7 
 
 		 179 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  59.43 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  59.43 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  53.57 
 
 		 420 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3733  CinA domain-containing protein  45.34 
 
 		 166 aa  127  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000115453 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  50.83 
 
 		 432 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  59.43 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  49.65 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  53.96 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  59.43 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  61.74 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  53.24 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  51.39 
 
 		 413 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  47.52 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  60.61 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  48.23 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  60.61 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  60.38 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  50.69 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  46.01 
 
 		 411 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  46.88 
 
 		 420 aa  124  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  47.14 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  49.63 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  48.59 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  46.94 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  50.74 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  45.33 
 
 		 165 aa  124  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  60.61 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  47.62 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0067  competence/damage inducible protein CinA  51.52 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0055  CinA domain-containing protein  51.52 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  45.86 
 
 		 371 aa  123  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  42.95 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  51.49 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  46.58 
 
 		 415 aa  122  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  53.85 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  43.79 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  48.1 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  60.61 
 
 		 166 aa  121  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  45.91 
 
 		 414 aa  121  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  48.92 
 
 		 165 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  57.58 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  47.14 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  46.36 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  49.32 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  44.23 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  49.32 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  46.43 
 
 		 172 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  58.65 
 
 		 418 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  47.14 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  49.32 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  51.88 
 
 		 424 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1579  CinA-like protein  48.7 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0260319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>