More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1579 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1579  CinA-like protein  100 
 
 		 160 aa  310  5.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0260319 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  59.48 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  65.69 
 
 		 161 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  65.69 
 
 		 161 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  64.08 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  60.87 
 
 		 140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  59.42 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3665  CinA domain-containing protein  64.34 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  58.21 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  52.56 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  52.6 
 
 		 203 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  51.92 
 
 		 208 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  51.3 
 
 		 211 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  57.14 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  54.55 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  59.85 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  55.8 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  55.07 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  53.42 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  51.66 
 
 		 208 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  56.64 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  49.06 
 
 		 206 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  59.71 
 
 		 156 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  50 
 
 		 208 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  52.23 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  54.9 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  57.64 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  56.03 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  58.27 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  66.95 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  54.9 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  56.74 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  56.74 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  66.95 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  66.95 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  56.03 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  56.03 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  54.74 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  54.74 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  66.1 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  53.99 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  57.35 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  55.32 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  54.74 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  56.03 
 
 		 166 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  57.35 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  57.35 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  57.35 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  57.35 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  57.35 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  57.35 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  57.35 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  56.03 
 
 		 184 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  62.1 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  62.1 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  62.1 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  56.3 
 
 		 175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  62.1 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  62.1 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  51.37 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  62.1 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  66.1 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  62.1 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  55 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  58.27 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  54.74 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  50.66 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  56.43 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  54.05 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1615  CinA domain protein  51.3 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  50.66 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  54.11 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  60.48 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  48.7 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  50.33 
 
 		 202 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  50.31 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  58.59 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  51.03 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  52.86 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  53.28 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  47.83 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  53.69 
 
 		 179 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  51.03 
 
 		 172 aa  121  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  51.43 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  55.22 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  52.21 
 
 		 168 aa  120  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  50.32 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  49.64 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  56.73 
 
 		 169 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  52.27 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  64.71 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  55.45 
 
 		 275 aa  116  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  52.48 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  60 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  48.61 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  53.03 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  52.45 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  47.02 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  51.41 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>