More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0608 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0608  CinA, C-terminal  100 
 
 		 259 aa  531  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2276  CinA domain-containing protein  50.62 
 
 		 160 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0906635  hitchhiker  0.00967543 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4777  CinA domain-containing protein  52.47 
 
 		 167 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0164  competence/damage-inducible protein CinA  51.23 
 
 		 173 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47070  CinA-related protein  48.73 
 
 		 163 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.797955  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3003  CinA domain-containing protein  46.01 
 
 		 167 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2431  CinA domain-containing protein  46.01 
 
 		 167 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.197767  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3298  CinA domain-containing protein  44.03 
 
 		 167 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36880  putative ompetence-damaged protein  41.51 
 
 		 172 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.217311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2789  CinA-like  39.38 
 
 		 171 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  45.86 
 
 		 166 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  44.94 
 
 		 166 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  44.94 
 
 		 166 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  41.83 
 
 		 164 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  41.18 
 
 		 164 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3170  CinA domain-containing protein  41.06 
 
 		 172 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  44.83 
 
 		 166 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  44.83 
 
 		 166 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  44.14 
 
 		 166 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  42.42 
 
 		 173 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  46.75 
 
 		 430 aa  105  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  44.14 
 
 		 166 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  44.83 
 
 		 166 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  44.52 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  43.45 
 
 		 184 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  43.97 
 
 		 165 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  44.37 
 
 		 166 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  42.95 
 
 		 163 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  42.86 
 
 		 166 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  42.86 
 
 		 166 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  43.45 
 
 		 166 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  42.76 
 
 		 166 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  41.03 
 
 		 175 aa  99  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  42.76 
 
 		 166 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  42.76 
 
 		 166 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  42.76 
 
 		 166 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  42.76 
 
 		 166 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  42.76 
 
 		 166 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  42.76 
 
 		 166 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  42.76 
 
 		 166 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  43.05 
 
 		 159 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  43.15 
 
 		 156 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  41.03 
 
 		 166 aa  96.3  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  38.85 
 
 		 160 aa  95.9  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  40.97 
 
 		 160 aa  95.9  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  37.82 
 
 		 168 aa  95.9  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  38.62 
 
 		 169 aa  94.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  42.48 
 
 		 422 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  43.79 
 
 		 179 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  39.61 
 
 		 160 aa  94  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  43.97 
 
 		 176 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  36.54 
 
 		 413 aa  92  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  36.81 
 
 		 165 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  36.81 
 
 		 165 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  44.63 
 
 		 431 aa  91.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  36.81 
 
 		 165 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  36.81 
 
 		 165 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  36.31 
 
 		 156 aa  91.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  36.81 
 
 		 165 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  36.81 
 
 		 165 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  36.81 
 
 		 165 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  42.41 
 
 		 168 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  36.6 
 
 		 166 aa  90.1  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  44.36 
 
 		 165 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  35.4 
 
 		 165 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  37.74 
 
 		 429 aa  90.5  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  36.2 
 
 		 165 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  36.2 
 
 		 165 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  36.2 
 
 		 165 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  36.2 
 
 		 165 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  37.58 
 
 		 164 aa  89.4  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  36.49 
 
 		 408 aa  89.4  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  42.28 
 
 		 169 aa  89.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  39.19 
 
 		 166 aa  89.4  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  39.19 
 
 		 166 aa  89.4  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  35.12 
 
 		 430 aa  89  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  42.34 
 
 		 426 aa  89  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0055  CinA domain-containing protein  40.46 
 
 		 162 aa  88.6  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  35.58 
 
 		 165 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  39.6 
 
 		 413 aa  88.6  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  36.42 
 
 		 162 aa  88.6  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0067  competence/damage inducible protein CinA  40.46 
 
 		 162 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  38.57 
 
 		 156 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  39.86 
 
 		 166 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  38.1 
 
 		 165 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  37.91 
 
 		 420 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  42.04 
 
 		 422 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  40 
 
 		 414 aa  87  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  35.58 
 
 		 165 aa  87  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0483  CinA domain protein  45.89 
 
 		 184 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  35.76 
 
 		 160 aa  86.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  45.87 
 
 		 418 aa  85.9  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  50 
 
 		 140 aa  85.9  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  41.89 
 
 		 175 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  35 
 
 		 420 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  41.84 
 
 		 175 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  40.14 
 
 		 161 aa  85.1  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  43.36 
 
 		 171 aa  85.1  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  33.11 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  37.5 
 
 		 165 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>