More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0678 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0678  NAD+ synthetase  100 
 
 
300 aa  610  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00181031  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3059  NAD+ synthetase  39.13 
 
 
514 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1822  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.65 
 
 
514 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0470  NAD+ synthetase  38.65 
 
 
514 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  32.7 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  28.51 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  30.04 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06585  NH(3)-dependent NAD synthetase  29.91 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.878387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  31.94 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1792  NAD+ synthetase  31.08 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0163  NAD synthetase  31.58 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  30.32 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  29.73 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0918  NAD+ synthetase  28.44 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.942289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  33.33 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  30.49 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0651  NAD synthetase  31.66 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  26.81 
 
 
567 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  30.7 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  30.84 
 
 
561 aa  75.5  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  26.91 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03015  NAD synthetase  30.17 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00527093  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4990  NAD synthetase  34.44 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0922  NAD+ synthetase  27.75 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3089  NAD synthetase  34.44 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0568  NAD+ synthetase  27.15 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0494  NAD synthetase  31.58 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5278  NAD synthetase  34.44 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.471439  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  30.09 
 
 
543 aa  73.9  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5167  NAD synthetase  34.05 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0848022 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01960  NAD synthetase  30.77 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03120  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.7 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0531  NH3-dependent NAD+ synthetase  30.18 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000693005  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  29.55 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3443  NAD synthetase  33.02 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3163  NAD synthetase  30.97 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000184927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  29.57 
 
 
552 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0275  NAD+ synthetase  27.76 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4638  NAD synthetase  34.05 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  27.78 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  27.17 
 
 
554 aa  73.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  29.96 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  29.43 
 
 
611 aa  72.8  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  29.06 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5646  NAD synthetase  31.5 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.899788  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  28.33 
 
 
571 aa  72.4  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  28.82 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0718  NAD synthetase  29.52 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.451004  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  28.82 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  29.52 
 
 
241 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  31.36 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  27.46 
 
 
574 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64980  NAD synthetase  31 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  30.28 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  26.99 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  29.07 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2091  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.27 
 
 
550 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1435  NAD+ synthetase  32.6 
 
 
529 aa  70.5  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0116683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1861  NAD synthetase  30.05 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl521  NH3-dependent NAD+ synthetase  28.89 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2526  NAD+ synthetase  26.96 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4778  NAD synthetase  30.48 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001341  NAD synthetase  26.99 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  29.36 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1510  NAD synthetase  31.14 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  29.92 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  29.54 
 
 
277 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  29.36 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0372  NAD synthetase  32.96 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.299221  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  26.46 
 
 
561 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.4 
 
 
577 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0607  NAD synthetase  26.82 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf282  NH(3)-dependent NAD+ synthetase  31.11 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000329858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  28.8 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  28.18 
 
 
599 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  30.64 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1826  NAD synthetase  29.94 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000200319  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3205  NAD synthetase  29.31 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2095  NAD synthetase  29.94 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1855  NAD synthetase  29.94 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1810  NAD synthetase  29.94 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.186711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2031  NAD synthetase  29.94 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0182600000000003e-40 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1998  NAD synthetase  29.94 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0798  NAD+ synthetase  28.37 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  29.37 
 
 
541 aa  66.6  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  27.03 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2191  NAD synthetase  28.63 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2000  NAD synthetase  29.94 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0019517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3329  NAD synthetase  29.94 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000156548  unclonable  3.14832e-25 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0652  NAD+ synthetase  25.39 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.11 
 
 
559 aa  65.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  28.4 
 
 
573 aa  65.9  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  28.85 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  28.57 
 
 
559 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  27.04 
 
 
561 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.48 
 
 
566 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4784  NAD synthetase  29.91 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391327  hitchhiker  0.000536951 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1898  NAD synthetase  28.79 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  25.99 
 
 
576 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0274  NAD synthetase  29.05 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.652864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>