More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3650 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3650  NAD synthetase  100 
 
 		 345 aa  715    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0488  NAD synthetase  88.2 
 
 		 342 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2865  NAD synthetase  53.04 
 
 		 323 aa  339  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2957  NAD synthetase  52.72 
 
 		 323 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4337  NAD synthetase  49.53 
 
 		 335 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0886031  normal  0.014304 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2788  NAD synthetase  51.28 
 
 		 323 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1248  NAD synthetase  50.16 
 
 		 324 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2881  NAD synthetase  49.24 
 
 		 330 aa  315  8e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4477  NAD synthetase  49.05 
 
 		 328 aa  311  6.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2382  NAD synthetase  49.51 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.846278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1083  NAD synthetase  48.77 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.402992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3178  NAD synthetase  48.16 
 
 		 328 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2868  NAD synthetase  45.6 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5317  NAD+ synthetase  44.01 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0269  NAD synthetase  38.91 
 
 		 330 aa  219  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0284  NAD+ synthetase  34.66 
 
 		 281 aa  166  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0283  NAD+ synthetase  34.69 
 
 		 281 aa  162  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000382877  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0086  NAD+ synthetase  32.95 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.485052  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0878  NAD+ synthetase  34.46 
 
 		 294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  28.22 
 
 		 254 aa  136  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  29.03 
 
 		 258 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  30.61 
 
 		 281 aa  133  5e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  31.8 
 
 		 258 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.23 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  31.06 
 
 		 247 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  27.76 
 
 		 258 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  29.22 
 
 		 238 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  32.4 
 
 		 250 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  28.15 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  30.3 
 
 		 246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  28.16 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1366  NAD+ synthetase  30.03 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  30.96 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  29 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  27.97 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  29.15 
 
 		 273 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  27.57 
 
 		 237 aa  106  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0248  NAD synthetase  30.52 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  29.46 
 
 		 245 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  27.71 
 
 		 246 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  30.71 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  27.71 
 
 		 246 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  28.46 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  29.45 
 
 		 269 aa  103  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  33.56 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  27.88 
 
 		 273 aa  102  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0922  NAD+ synthetase  29.44 
 
 		 246 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  27.71 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  28.29 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  28.29 
 
 		 277 aa  100  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  28.85 
 
 		 264 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2526  NAD+ synthetase  30.08 
 
 		 246 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1544  NAD+ synthetase  32.11 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  38.03 
 
 		 263 aa  98.2  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  37.32 
 
 		 263 aa  96.7  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl521  NH3-dependent NAD+ synthetase  28.1 
 
 		 244 aa  95.9  9e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1437  NAD+ synthetase  29.53 
 
 		 249 aa  95.9  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2324  NAD+ synthetase  28.9 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  33.92 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0310  NAD synthetase  31.34 
 
 		 267 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.737359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0918  NAD+ synthetase  28.87 
 
 		 256 aa  94.4  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.942289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0798  NAD+ synthetase  28.16 
 
 		 255 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  26.52 
 
 		 283 aa  92.8  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  25.97 
 
 		 273 aa  92.4  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0531  NH3-dependent NAD+ synthetase  44 
 
 		 253 aa  92  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000693005  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  27.31 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  26.36 
 
 		 273 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2901  NAD+ synthetase  35.62 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1444  NAD+ synthetase  39.01 
 
 		 279 aa  90.1  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  25.71 
 
 		 246 aa  89.7  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  27.2 
 
 		 277 aa  89  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  27.99 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0926  NAD+ synthetase  31.79 
 
 		 248 aa  87.4  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.486288  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1792  NAD+ synthetase  28.57 
 
 		 268 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0716  NAD synthetase  35.88 
 
 		 264 aa  87.4  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  25.59 
 
 		 250 aa  87  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  27.31 
 
 		 277 aa  86.3  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  26.43 
 
 		 622 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  25.94 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1044  NAD+ synthetase  34.75 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06585  NH(3)-dependent NAD synthetase  25.32 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.878387  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  36.84 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  26.9 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01960  NAD synthetase  28.99 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  27.38 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  39.39 
 
 		 241 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  26.32 
 
 		 571 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0568  NAD+ synthetase  30.96 
 
 		 259 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2324  NAD+ synthetase  26.27 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0297983  hitchhiker  0.00625352 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0652  NAD+ synthetase  23.55 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  25.39 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1552  NAD synthetase  28.06 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  24.83 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3918  NAD synthetase  26.59 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0524773  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  25.7 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1758  NAD synthetase  28 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4602  NAD+ synthetase  29.66 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6284  NAD+ synthetase  27.69 
 
 		 566 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000396806  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  27.24 
 
 		 540 aa  76.3  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1327  NAD synthetase  30.5 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>