247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2324 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2324  NAD+ synthetase  100 
 
 		 326 aa  673    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0297983  hitchhiker  0.00625352 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0284  NAD+ synthetase  32.03 
 
 		 281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0283  NAD+ synthetase  31.67 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000382877  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0878  NAD+ synthetase  31.01 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4337  NAD synthetase  28.93 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0886031  normal  0.014304 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2865  NAD synthetase  29.08 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2957  NAD synthetase  29.08 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2881  NAD synthetase  30.86 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0086  NAD+ synthetase  29.59 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.485052  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2382  NAD synthetase  28.83 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.846278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2788  NAD synthetase  28.36 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1248  NAD synthetase  29.63 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0275  NAD+ synthetase  24.75 
 
 		 289 aa  99.8  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3650  NAD synthetase  26.27 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1083  NAD synthetase  31.85 
 
 		 328 aa  95.9  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.402992  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  28.27 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  25.84 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  25.34 
 
 		 271 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  26.6 
 
 		 277 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  24.33 
 
 		 273 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  28 
 
 		 264 aa  92.8  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  26.42 
 
 		 283 aa  92.8  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2868  NAD synthetase  29.8 
 
 		 332 aa  92.8  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  26.82 
 
 		 276 aa  92.4  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3178  NAD synthetase  30.22 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  25 
 
 		 273 aa  90.1  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0488  NAD synthetase  26.8 
 
 		 342 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  25.91 
 
 		 277 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0269  NAD synthetase  27.57 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  27.61 
 
 		 254 aa  88.2  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  24.5 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  24.67 
 
 		 273 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  27.12 
 
 		 246 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  26.54 
 
 		 277 aa  86.3  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.11 
 
 		 258 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  27.96 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  25.08 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  29.14 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  27.11 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  25.75 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  26.98 
 
 		 277 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  28 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4477  NAD synthetase  24.09 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  25 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5317  NAD+ synthetase  25.42 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  33.91 
 
 		 622 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  23.18 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  23.6 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1444  NAD+ synthetase  34.11 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  31.3 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  28 
 
 		 543 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  31.3 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.9 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  25.08 
 
 		 557 aa  67  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  33.82 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  32.76 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  32.09 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1044  NAD+ synthetase  31.97 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  25.19 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0248  NAD synthetase  27.59 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0716  NAD synthetase  32.76 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19800  NAD+ synthetase  22.59 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.497011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  25.08 
 
 		 545 aa  63.2  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  22.81 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  26.06 
 
 		 544 aa  62.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  25.38 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  25.24 
 
 		 545 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  24.62 
 
 		 246 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  22.71 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  36.78 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  25.38 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  23.32 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  29.31 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  25.25 
 
 		 576 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  25.45 
 
 		 577 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  23.57 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  25.57 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  24.24 
 
 		 573 aa  60.1  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  24.61 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  23.83 
 
 		 536 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  23.83 
 
 		 536 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1544  NAD+ synthetase  24.61 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  23.38 
 
 		 572 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  25.89 
 
 		 561 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  40 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1593  NAD synthetase  26.13 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.635718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  25 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2901  NAD+ synthetase  31.91 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  25.7 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.75 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  24.68 
 
 		 569 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  23.38 
 
 		 572 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  24.49 
 
 		 541 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0982  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  23.78 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  23.38 
 
 		 572 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  25.44 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  26.9 
 
 		 571 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0926  NAD+ synthetase  30.39 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.486288  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0217  NAD+ synthetase  25.08 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  22.9 
 
 		 576 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>