More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2868 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2868  NAD synthetase  100 
 
 
332 aa  686    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1083  NAD synthetase  66.36 
 
 
328 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.402992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3178  NAD synthetase  66.77 
 
 
328 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2788  NAD synthetase  56.96 
 
 
323 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2957  NAD synthetase  54.89 
 
 
323 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2865  NAD synthetase  54.89 
 
 
323 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2382  NAD synthetase  57.79 
 
 
334 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.846278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1248  NAD synthetase  54.75 
 
 
324 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2881  NAD synthetase  54.32 
 
 
330 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4337  NAD synthetase  55.24 
 
 
335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0886031  normal  0.014304 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4477  NAD synthetase  55.99 
 
 
328 aa  352  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3650  NAD synthetase  45.6 
 
 
345 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0488  NAD synthetase  46.18 
 
 
342 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5317  NAD+ synthetase  48.62 
 
 
325 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288579  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0269  NAD synthetase  34.42 
 
 
330 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0878  NAD+ synthetase  35.23 
 
 
294 aa  149  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0283  NAD+ synthetase  37.65 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000382877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0284  NAD+ synthetase  37.25 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  33.56 
 
 
258 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  32.86 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  30.28 
 
 
254 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  32.72 
 
 
265 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.64 
 
 
258 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  29.72 
 
 
281 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  32.08 
 
 
258 aa  112  9e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1544  NAD+ synthetase  31.4 
 
 
332 aa  112  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  31.38 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0086  NAD+ synthetase  29.25 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.485052  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  29.21 
 
 
263 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  33.6 
 
 
275 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  29.24 
 
 
245 aa  105  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  29.26 
 
 
285 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  33.47 
 
 
277 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  29.53 
 
 
277 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  32.03 
 
 
302 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  31.3 
 
 
238 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  33.88 
 
 
264 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.55 
 
 
251 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  30.23 
 
 
261 aa  99.4  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  31.8 
 
 
264 aa  99  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  30.8 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  29.15 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  29.96 
 
 
277 aa  96.3  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0248  NAD synthetase  32.03 
 
 
270 aa  96.3  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  27.49 
 
 
246 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  27.9 
 
 
284 aa  94  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1366  NAD+ synthetase  30.51 
 
 
241 aa  93.6  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  28.35 
 
 
277 aa  92  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  33.46 
 
 
276 aa  92  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  27.61 
 
 
237 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0310  NAD synthetase  35.14 
 
 
267 aa  90.9  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.737359  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  28.68 
 
 
276 aa  90.5  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  26.77 
 
 
622 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.69 
 
 
247 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0798  NAD+ synthetase  27.45 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  25.98 
 
 
263 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  28.33 
 
 
283 aa  87  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  26.39 
 
 
273 aa  86.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  30.89 
 
 
250 aa  86.3  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  25.4 
 
 
263 aa  86.3  7e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  31.84 
 
 
241 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  27.13 
 
 
271 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0531  NH3-dependent NAD+ synthetase  28.52 
 
 
253 aa  85.9  0.000000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000693005  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2324  NAD+ synthetase  29.26 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl521  NH3-dependent NAD+ synthetase  29.1 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  28.57 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  29.15 
 
 
574 aa  84.3  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  25 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4869  NAD synthetase  27.45 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1792  NAD+ synthetase  27.34 
 
 
268 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  40.78 
 
 
243 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  25.19 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4925  NAD synthetase  27.12 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2526  NAD+ synthetase  26.51 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4747  NAD synthetase  27.36 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000246424 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0918  NAD+ synthetase  26.94 
 
 
256 aa  79  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.942289  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  27.47 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0926  NAD+ synthetase  28.26 
 
 
248 aa  79  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.486288  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  25.98 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4661  NAD synthetase  26.95 
 
 
275 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2324  NAD+ synthetase  28.4 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0297983  hitchhiker  0.00625352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1410  NAD synthetase  38.53 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0652  NAD+ synthetase  26.14 
 
 
271 aa  75.5  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0275  NAD+ synthetase  26.23 
 
 
289 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0957  NAD synthetase  28.42 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0182  NAD+ synthetase  28 
 
 
526 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3163  NAD synthetase  40.57 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000184927  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0494  NAD synthetase  27.84 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.05 
 
 
576 aa  73.2  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2901  NAD+ synthetase  36.36 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1437  NAD+ synthetase  39 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1542  NAD synthetase  36.5 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496259  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0752  NAD+ synthetase  26.61 
 
 
560 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.204171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0922  NAD+ synthetase  27.05 
 
 
246 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0594  NAD synthetase  37.74 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  23.46 
 
 
250 aa  72  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  26.71 
 
 
545 aa  72  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01960  NAD synthetase  29.84 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  25.31 
 
 
567 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1552  NAD synthetase  37.31 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.022001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>