More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0488 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0488  NAD synthetase  100 
 
 		 342 aa  709    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3650  NAD synthetase  88.2 
 
 		 345 aa  591  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2865  NAD synthetase  52.2 
 
 		 323 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2957  NAD synthetase  51.89 
 
 		 323 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2881  NAD synthetase  51.26 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4337  NAD synthetase  48.9 
 
 		 335 aa  322  9.000000000000001e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0886031  normal  0.014304 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2788  NAD synthetase  50.16 
 
 		 323 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2382  NAD synthetase  48.72 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.846278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1248  NAD synthetase  49.06 
 
 		 324 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4477  NAD synthetase  47.83 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1083  NAD synthetase  48.12 
 
 		 328 aa  295  8e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.402992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3178  NAD synthetase  47.5 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2868  NAD synthetase  46.18 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5317  NAD+ synthetase  43.53 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0269  NAD synthetase  37.67 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0284  NAD+ synthetase  36.18 
 
 		 281 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0283  NAD+ synthetase  36.33 
 
 		 281 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000382877  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0086  NAD+ synthetase  31.85 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.485052  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0878  NAD+ synthetase  32.3 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  27.53 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  28.79 
 
 		 281 aa  132  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  29.96 
 
 		 258 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  30.34 
 
 		 258 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.32 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  28.46 
 
 		 258 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  29.34 
 
 		 238 aa  116  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.35 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  28.04 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  31.6 
 
 		 250 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  29.84 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  27.53 
 
 		 263 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  25.16 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  27.62 
 
 		 263 aa  106  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  29.67 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  27.21 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1366  NAD+ synthetase  29.55 
 
 		 241 aa  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0531  NH3-dependent NAD+ synthetase  28.85 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000693005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  28.57 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1544  NAD+ synthetase  30.99 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  27.94 
 
 		 237 aa  99.8  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  27.63 
 
 		 273 aa  99.8  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  26.87 
 
 		 273 aa  99.4  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0922  NAD+ synthetase  28.52 
 
 		 246 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  27.51 
 
 		 277 aa  99  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  28.47 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  29.15 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  25.08 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  26.61 
 
 		 246 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  26.61 
 
 		 246 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  29.43 
 
 		 245 aa  96.7  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  29.51 
 
 		 269 aa  95.9  9e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  28.57 
 
 		 241 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  27.86 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2526  NAD+ synthetase  28.52 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  28.19 
 
 		 277 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  26.21 
 
 		 246 aa  94.4  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  26.25 
 
 		 273 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0798  NAD+ synthetase  28.57 
 
 		 255 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  27.27 
 
 		 263 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  27.73 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  28.14 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl521  NH3-dependent NAD+ synthetase  28.09 
 
 		 244 aa  91.3  2e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  28.22 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0918  NAD+ synthetase  28.22 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.942289  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  28.51 
 
 		 302 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  25.1 
 
 		 622 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  38.21 
 
 		 243 aa  89.7  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0248  NAD synthetase  27.76 
 
 		 270 aa  89.4  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1437  NAD+ synthetase  26.95 
 
 		 249 aa  89.7  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1025  NAD+ synthetase  24.11 
 
 		 247 aa  89.4  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2324  NAD+ synthetase  38.89 
 
 		 248 aa  86.7  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0310  NAD synthetase  27.24 
 
 		 267 aa  86.3  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.737359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  27.38 
 
 		 267 aa  85.9  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1444  NAD+ synthetase  36.88 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2901  NAD+ synthetase  32.65 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  24.8 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0716  NAD synthetase  32 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  24.5 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1552  NAD synthetase  28.09 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1792  NAD+ synthetase  27.64 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01960  NAD synthetase  29.79 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  32.06 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06585  NH(3)-dependent NAD synthetase  26.4 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.878387  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  25.09 
 
 		 284 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0926  NAD+ synthetase  28.29 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.486288  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  35.34 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0568  NAD+ synthetase  29.71 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03015  NAD synthetase  27.17 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00527093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  27.97 
 
 		 277 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1758  NAD synthetase  27.74 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3163  NAD synthetase  26.79 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000184927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2294  NAD synthetase  27.68 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  26.69 
 
 		 571 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  24.82 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3609  NAD synthetase  27.55 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1327  NAD synthetase  32.92 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  30.5 
 
 		 246 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.75 
 
 		 543 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1044  NAD+ synthetase  27.85 
 
 		 268 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03120  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.27 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>