More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2881 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2881  NAD synthetase  100 
 
 
330 aa  680    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4337  NAD synthetase  78.57 
 
 
335 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0886031  normal  0.014304 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2788  NAD synthetase  61.46 
 
 
323 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1083  NAD synthetase  61.25 
 
 
328 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.402992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2865  NAD synthetase  60.57 
 
 
323 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3178  NAD synthetase  61.04 
 
 
328 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2957  NAD synthetase  60.88 
 
 
323 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1248  NAD synthetase  58.13 
 
 
324 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4477  NAD synthetase  55.83 
 
 
328 aa  374  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2868  NAD synthetase  54.32 
 
 
332 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2382  NAD synthetase  57.1 
 
 
334 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.846278  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3650  NAD synthetase  49.24 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0488  NAD synthetase  51.88 
 
 
342 aa  315  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5317  NAD+ synthetase  50 
 
 
325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288579  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0269  NAD synthetase  33.67 
 
 
330 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0878  NAD+ synthetase  31.84 
 
 
294 aa  143  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0284  NAD+ synthetase  33.21 
 
 
281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0283  NAD+ synthetase  33.46 
 
 
281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000382877  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0086  NAD+ synthetase  29.92 
 
 
279 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.485052  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  26.94 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  28.28 
 
 
258 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  27.76 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.05 
 
 
258 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  31.6 
 
 
247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  31.01 
 
 
245 aa  109  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  28.25 
 
 
281 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  26.24 
 
 
254 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  30.53 
 
 
238 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  25.25 
 
 
258 aa  107  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  31.73 
 
 
275 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  32.43 
 
 
243 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  29.33 
 
 
277 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  29.5 
 
 
246 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  28.68 
 
 
285 aa  99.8  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  27.53 
 
 
263 aa  99.4  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  28.68 
 
 
273 aa  99  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  29.84 
 
 
283 aa  99  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  26.38 
 
 
263 aa  98.6  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  27.81 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  28.91 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  30.21 
 
 
277 aa  97.4  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  29.04 
 
 
269 aa  97.1  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  28.52 
 
 
271 aa  95.9  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  26.86 
 
 
273 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  29.52 
 
 
273 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  29.73 
 
 
264 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  27.37 
 
 
622 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  28.57 
 
 
263 aa  93.6  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0798  NAD+ synthetase  28.57 
 
 
255 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  29.37 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  27.86 
 
 
263 aa  92.4  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1544  NAD+ synthetase  31.37 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  28.11 
 
 
276 aa  91.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  31.4 
 
 
277 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  28.9 
 
 
302 aa  89.7  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  29.85 
 
 
283 aa  89.7  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01960  NAD synthetase  29.17 
 
 
302 aa  89.4  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2324  NAD+ synthetase  29.1 
 
 
326 aa  89.4  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0297983  hitchhiker  0.00625352 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  26.95 
 
 
278 aa  89  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  27.61 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0652  NAD+ synthetase  26.48 
 
 
271 aa  89  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  29.05 
 
 
237 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  28.68 
 
 
250 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  28.8 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  29.48 
 
 
261 aa  87.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  27.61 
 
 
273 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1366  NAD+ synthetase  27.91 
 
 
241 aa  85.9  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1327  NAD synthetase  31.95 
 
 
288 aa  85.9  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168504  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.41 
 
 
251 aa  85.9  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl521  NH3-dependent NAD+ synthetase  28.47 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05230  NAD synthetase  30.86 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0651  NAD synthetase  29.96 
 
 
277 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  30.57 
 
 
241 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0922  NAD+ synthetase  27.8 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1552  NAD synthetase  29.9 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.022001  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2658  NAD synthetase  31.48 
 
 
276 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2324  NAD+ synthetase  27.31 
 
 
248 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0248  NAD synthetase  30.07 
 
 
270 aa  84  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1803  NAD synthetase  31.48 
 
 
276 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00266158  hitchhiker  0.0000311933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2543  NAD synthetase  31.48 
 
 
276 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.680387  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0918  NAD+ synthetase  25.76 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.942289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2581  NAD synthetase  31.11 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0153325  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0926  NAD+ synthetase  35.86 
 
 
248 aa  82.4  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.486288  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001341  NAD synthetase  29.48 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0310  NAD synthetase  29 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.737359  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1432  NAD synthetase  30.34 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0922379  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0494  NAD synthetase  29.75 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2021  NAD synthetase  30.6 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2791  NAD synthetase  28.81 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1802  NAD synthetase  27.72 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0607  NAD synthetase  29.85 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  27.84 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2526  NAD+ synthetase  25.87 
 
 
246 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4602  NAD+ synthetase  32.33 
 
 
276 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  29.37 
 
 
276 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3205  NAD synthetase  26.25 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4661  NAD synthetase  28.32 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  27.27 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0957  NAD synthetase  30.15 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  27.27 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>