More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1083 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3178  NAD synthetase  96.95 
 
 		 328 aa  655    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1083  NAD synthetase  100 
 
 		 328 aa  674    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.402992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2868  NAD synthetase  66.36 
 
 		 332 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2865  NAD synthetase  60.38 
 
 		 323 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2957  NAD synthetase  61.13 
 
 		 323 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2788  NAD synthetase  59.43 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2881  NAD synthetase  61.25 
 
 		 330 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4477  NAD synthetase  59.38 
 
 		 328 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4337  NAD synthetase  58.75 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0886031  normal  0.014304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1248  NAD synthetase  57.23 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2382  NAD synthetase  57.1 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.846278  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3650  NAD synthetase  48.77 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0488  NAD synthetase  49.66 
 
 		 342 aa  285  8e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5317  NAD+ synthetase  52.43 
 
 		 325 aa  265  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0269  NAD synthetase  32.17 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0283  NAD+ synthetase  35.02 
 
 		 281 aa  146  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000382877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0284  NAD+ synthetase  36.89 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0878  NAD+ synthetase  33.46 
 
 		 294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  30.07 
 
 		 258 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  30.18 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  30.43 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  28.05 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.28 
 
 		 258 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  30.87 
 
 		 263 aa  119  7.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1544  NAD+ synthetase  34.98 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  31.15 
 
 		 275 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  30.83 
 
 		 263 aa  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  34.31 
 
 		 238 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  30.71 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  32.34 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  31.54 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  33.09 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  29.49 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  28.2 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0248  NAD synthetase  32.9 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0086  NAD+ synthetase  29.29 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.485052  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  27.69 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  31.56 
 
 		 247 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  29.47 
 
 		 277 aa  99.4  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.83 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2324  NAD+ synthetase  31.14 
 
 		 248 aa  96.7  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  32.89 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  29.74 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  27.45 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  27.45 
 
 		 263 aa  93.6  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1366  NAD+ synthetase  31.95 
 
 		 241 aa  93.6  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  27.37 
 
 		 284 aa  92.8  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  30.86 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  27.7 
 
 		 237 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  31.3 
 
 		 246 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  30.89 
 
 		 243 aa  89.7  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  27.8 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  28.35 
 
 		 277 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  26.43 
 
 		 622 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  31.3 
 
 		 283 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  27.31 
 
 		 246 aa  86.7  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  27.31 
 
 		 246 aa  86.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1021  NAD synthetase  29.21 
 
 		 276 aa  85.9  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  27.31 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0310  NAD synthetase  31.96 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.737359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  29.46 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0607  NAD synthetase  28.62 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  28.16 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  27.59 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0957  NAD synthetase  30.15 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01960  NAD synthetase  30.22 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  31.78 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2543  NAD synthetase  30.18 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.680387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2658  NAD synthetase  30.18 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  29.02 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1803  NAD synthetase  30.18 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00266158  hitchhiker  0.0000311933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2581  NAD synthetase  29.82 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0153325  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  28.22 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0798  NAD+ synthetase  28.93 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2324  NAD+ synthetase  31.85 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0297983  hitchhiker  0.00625352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1792  NAD+ synthetase  26.87 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1542  NAD synthetase  28.77 
 
 		 276 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496259  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0651  NAD synthetase  26.25 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0926  NAD+ synthetase  28.51 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.486288  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0531  NH3-dependent NAD+ synthetase  30.92 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000693005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0922  NAD+ synthetase  26.5 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1327  NAD synthetase  29.17 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1410  NAD synthetase  39.25 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2438  NAD synthetase  27.47 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  25 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  28.26 
 
 		 540 aa  76.6  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03120  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  25.62 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  25.29 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl521  NH3-dependent NAD+ synthetase  28.16 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  40.78 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  27.84 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2246  NAD synthetase  27.41 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000924504  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2318  NAD synthetase  27.41 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000738561  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0494  NAD synthetase  25.62 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0837  NAD synthetase  29.41 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2791  NAD synthetase  30.04 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2021  NAD synthetase  28.09 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  26.46 
 
 		 546 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2294  NAD synthetase  29.55 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206886  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0652  NAD+ synthetase  24.57 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>