62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1669 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1669  ExsB family protein  100 
 
 
303 aa  619  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1742  ExsB family protein  98.35 
 
 
303 aa  609  1e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1605  ExsB family protein  54.7 
 
 
342 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1080  ExsB family protein  53.42 
 
 
358 aa  322  6e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.420451  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0537  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.19 
 
 
322 aa  315  7e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.366098  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1718  hypothetical protein  35.14 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1824  PP-loop domain-containing protein  37.33 
 
 
268 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1781  ExsB family protein  35.33 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762321  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1079  hypothetical protein  34.42 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2123  PP-loop domain-containing protein  34.67 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1003  hypothetical protein  28.69 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.309072  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1663  hypothetical protein  29.93 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0177  tRNA methyl transferase-like protein  33.55 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17621  PP family ATPase  30.14 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3314  hypothetical protein  32.65 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0361  PP-loop domain protein  31.79 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101562  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1387  hypothetical protein  32.65 
 
 
275 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000185278  normal  0.88629 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2185  hypothetical protein  31.33 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999968  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1583  ExsB family protein  31.54 
 
 
274 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16911  PP family ATPase  30 
 
 
288 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0923  ExsB family protein  32.45 
 
 
269 aa  49.3  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1608  PP-loop domain protein  31.54 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1629  PP-loop domain-containing protein  33.77 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20171  PP family ATPase  31.08 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  29.14 
 
 
268 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2185  hypothetical protein  29.05 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0342  PP-loop domain protein  30.46 
 
 
268 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.09066e-30 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22871  ATP-utilizing enzymes of the PP-loop superfamily protein  28.67 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6080  ExsB family protein  28.1 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1143  hypothetical protein  31.08 
 
 
280 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4689  hypothetical protein  31.58 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.605066  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1063  ExsB family protein  28.77 
 
 
272 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2511  hypothetical protein  29.14 
 
 
271 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0316304 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.92 
 
 
591 aa  47  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1937  hypothetical protein  29.45 
 
 
292 aa  47  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1028  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  28.66 
 
 
276 aa  46.6  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1431  hypothetical protein  31.41 
 
 
267 aa  46.2  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17781  PP family ATPase  27.4 
 
 
274 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1279  Queuosine synthesis-like protein  30.2 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  29.66 
 
 
472 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2938  ExsB family protein  39.34 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000232553  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17581  PP family ATPase  28.08 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.414298  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1612  ExsB family protein  27.81 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2865  ExsB family protein  29.93 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000508984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  25.64 
 
 
599 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1841  hypothetical protein  30.87 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226764  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2987  hypothetical protein  32.89 
 
 
280 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000894357  normal  0.775366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1342  ExsB family protein  31.33 
 
 
285 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2118  ExsB family protein  27.45 
 
 
268 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2203  queuosine synthesis-like protein  27.81 
 
 
273 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.12352  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1151  PP-loop domain-containing protein  27.15 
 
 
271 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.293565  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0340  ExsB family protein  25.83 
 
 
265 aa  43.9  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  29.49 
 
 
598 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0693  PP-loop domain-containing protein  27.81 
 
 
282 aa  43.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3010  hypothetical protein  28.08 
 
 
276 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503965  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2220  ExsB family protein  32.24 
 
 
286 aa  42.7  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  41.94 
 
 
583 aa  42.7  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  41.94 
 
 
576 aa  42.7  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2054  asparagine synthase  29.87 
 
 
317 aa  42.7  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1000  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  29.22 
 
 
289 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  41.94 
 
 
576 aa  42.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0536  hypothetical protein  31.37 
 
 
269 aa  42.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.114391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>