148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0361 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0361  PP-loop domain protein  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0342  PP-loop domain protein  96.64 
 
 		 268 aa  528  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.09066e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3906  PP-loop domain-containing protein  70.04 
 
 		 296 aa  381  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000213353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2987  hypothetical protein  67.91 
 
 		 280 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000894357  normal  0.775366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0536  hypothetical protein  66.92 
 
 		 269 aa  358  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.114391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1202  PP-loop domain protein  53.76 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000899133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1049  hypothetical protein  55.09 
 
 		 275 aa  281  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1841  hypothetical protein  52.45 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2220  ExsB family protein  51.87 
 
 		 286 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2431  hypothetical protein  52.87 
 
 		 273 aa  261  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2511  hypothetical protein  48.08 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0316304 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0923  ExsB family protein  49.05 
 
 		 269 aa  258  6e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1629  PP-loop domain-containing protein  51.5 
 
 		 278 aa  258  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2865  ExsB family protein  50.57 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000508984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1079  hypothetical protein  50 
 
 		 279 aa  256  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2271  hypothetical protein  52.69 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04890  conserved hypothetical protein TIGR00268  52.47 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4189  Queuosine synthesis-like protein  51.5 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.653788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1342  ExsB family protein  50.38 
 
 		 285 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1385  ExsB family protein  47.73 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352849  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  47.73 
 
 		 268 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1608  PP-loop domain protein  45.59 
 
 		 274 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0151  PP-loop domain-containing protein  46.59 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1583  ExsB family protein  45.59 
 
 		 274 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1063  ExsB family protein  45.91 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1708  ExsB family protein  47.91 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2203  queuosine synthesis-like protein  44.91 
 
 		 273 aa  228  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.12352  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3710  hypothetical protein  49.62 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.509319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1279  Queuosine synthesis-like protein  46.09 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3314  hypothetical protein  44.66 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1637  PP family ATPase  43.77 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3010  hypothetical protein  44.66 
 
 		 276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2118  ExsB family protein  45.42 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0159  hypothetical protein  43.13 
 
 		 283 aa  222  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.018971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4689  hypothetical protein  43.8 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.605066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1542  hypothetical protein  48.68 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138904  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1387  hypothetical protein  44.27 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000185278  normal  0.88629 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2413  hypothetical protein  48.68 
 
 		 284 aa  215  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.246875  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1937  hypothetical protein  46.09 
 
 		 292 aa  215  8e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17581  PP family ATPase  43.25 
 
 		 252 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.414298  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1824  PP-loop domain-containing protein  43.35 
 
 		 268 aa  211  9e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2325  hypothetical protein  47.92 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2603  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  45.88 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17781  PP family ATPase  41 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2226  ExsB family protein  43.58 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17621  PP family ATPase  41 
 
 		 274 aa  208  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2123  PP-loop domain-containing protein  44.18 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2938  ExsB family protein  45.59 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000232553  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2054  asparagine synthase  44.57 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0177  tRNA methyl transferase-like protein  44.94 
 
 		 313 aa  204  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1663  hypothetical protein  40.61 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1028  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  43.23 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1151  PP-loop domain-containing protein  39.54 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.293565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0693  PP-loop domain-containing protein  41.42 
 
 		 282 aa  202  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443839  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0392  hypothetical protein  44.14 
 
 		 275 aa  202  5e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20171  PP family ATPase  41.96 
 
 		 280 aa  201  9e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1143  hypothetical protein  41.96 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  44.4 
 
 		 472 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1000  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  44.53 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1781  ExsB family protein  41.76 
 
 		 268 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762321  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2185  hypothetical protein  39.47 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2185  hypothetical protein  40.54 
 
 		 294 aa  195  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22871  ATP-utilizing enzymes of the PP-loop superfamily protein  42.21 
 
 		 279 aa  195  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16911  PP family ATPase  41.41 
 
 		 288 aa  195  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1595  ExsB family protein  43.66 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1596  hypothetical protein  41.29 
 
 		 265 aa  192  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.659522  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0255  hypothetical protein  39.33 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6080  ExsB family protein  43.4 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0147  ExsB family protein  43.4 
 
 		 486 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0722  hypothetical protein  38.95 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31120  conserved hypothetical protein TIGR00268  42.04 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1718  hypothetical protein  41.04 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1214  PP-loop domain-containing protein  40.46 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1558  hypothetical protein  42.34 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1060  PP-loop domain-containing protein  39.46 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1003  hypothetical protein  39.76 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.309072  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0340  ExsB family protein  36.4 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1704  PP-loop domain protein  33.33 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0697664  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1431  hypothetical protein  36.55 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4914  ExsB family protein  39.25 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1841  hypothetical protein  40.82 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0429  hypothetical protein  39.07 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0368  hypothetical protein  36.72 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1465  hypothetical protein  39.44 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.944037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0017  hypothetical protein  36.92 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000871636  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1612  ExsB family protein  33.85 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1058  ExsB family protein  42.6 
 
 		 210 aa  112  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1357  hypothetical protein  33.91 
 
 		 273 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  hitchhiker  0.00844883 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3800  PP family ATPase  35.86 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3008  hypothetical protein  32.85 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2468  hypothetical protein  32.16 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000271324  hitchhiker  0.000588391 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1434  ExsB family protein  30.35 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.672941  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0485  ExsB family protein  30.74 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_5288  predicted protein  34.57 
 
 		 188 aa  96.7  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0250872  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0352  PP-loop domain-containing protein  29.18 
 
 		 258 aa  92.8  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0092  hypothetical protein  36.45 
 
 		 310 aa  92  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0553  hypothetical protein  30.52 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.757724  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0184  ExsB family protein  25 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1669  ExsB family protein  31.79 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1742  ExsB family protein  31.79 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>