114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1049 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1049  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2987  hypothetical protein  60.37 
 
 
280 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000894357  normal  0.775366 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1202  PP-loop domain protein  54.55 
 
 
276 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000899133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0536  hypothetical protein  57.41 
 
 
269 aa  288  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.114391  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0923  ExsB family protein  51.32 
 
 
269 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2865  ExsB family protein  52.22 
 
 
278 aa  285  5e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000508984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3906  PP-loop domain-containing protein  56.32 
 
 
296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000213353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0361  PP-loop domain protein  55.09 
 
 
268 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0342  PP-loop domain protein  55.09 
 
 
268 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.09066e-30 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1841  hypothetical protein  50.94 
 
 
269 aa  279  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226764  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2271  hypothetical protein  55.94 
 
 
284 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2220  ExsB family protein  49.62 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1079  hypothetical protein  52.69 
 
 
279 aa  265  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1385  ExsB family protein  49.42 
 
 
267 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2511  hypothetical protein  47.33 
 
 
271 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0316304 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1708  ExsB family protein  50.94 
 
 
278 aa  255  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0151  PP-loop domain-containing protein  46.44 
 
 
270 aa  251  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04890  conserved hypothetical protein TIGR00268  49.07 
 
 
272 aa  248  6e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1629  PP-loop domain-containing protein  49.05 
 
 
278 aa  248  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  45.45 
 
 
268 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1342  ExsB family protein  47.96 
 
 
285 aa  245  6.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4189  Queuosine synthesis-like protein  50.57 
 
 
296 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.653788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3314  hypothetical protein  46.59 
 
 
275 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3010  hypothetical protein  45.52 
 
 
276 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503965  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2431  hypothetical protein  47.33 
 
 
273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1583  ExsB family protein  45.86 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1063  ExsB family protein  46.72 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1637  PP family ATPase  44.57 
 
 
267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141063  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1608  PP-loop domain protein  45.86 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1542  hypothetical protein  50.19 
 
 
284 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2325  hypothetical protein  49.81 
 
 
284 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2413  hypothetical protein  49.81 
 
 
284 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.246875  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4689  hypothetical protein  44.32 
 
 
281 aa  229  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.605066  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2203  queuosine synthesis-like protein  43.66 
 
 
273 aa  224  9e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.12352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2226  ExsB family protein  45.04 
 
 
265 aa  221  8e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1387  hypothetical protein  43.02 
 
 
275 aa  219  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000185278  normal  0.88629 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0392  hypothetical protein  45.93 
 
 
275 aa  219  5e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1596  hypothetical protein  45.45 
 
 
265 aa  219  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.659522  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1937  hypothetical protein  44.32 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2118  ExsB family protein  43.56 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0693  PP-loop domain-containing protein  41.22 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443839  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0159  hypothetical protein  42.16 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.018971 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1824  PP-loop domain-containing protein  43.13 
 
 
268 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2938  ExsB family protein  45.04 
 
 
261 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000232553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0722  hypothetical protein  41.83 
 
 
272 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22871  ATP-utilizing enzymes of the PP-loop superfamily protein  43.3 
 
 
279 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1151  PP-loop domain-containing protein  39.78 
 
 
271 aa  203  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.293565  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16911  PP family ATPase  43.53 
 
 
288 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0255  hypothetical protein  40.07 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2603  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  44.08 
 
 
334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.153014  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1279  Queuosine synthesis-like protein  40.47 
 
 
261 aa  198  7.999999999999999e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2123  PP-loop domain-containing protein  39.41 
 
 
278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0177  tRNA methyl transferase-like protein  42.07 
 
 
313 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17581  PP family ATPase  40.64 
 
 
252 aa  195  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.414298  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17621  PP family ATPase  41 
 
 
274 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1663  hypothetical protein  41 
 
 
274 aa  195  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1781  ExsB family protein  40.23 
 
 
268 aa  194  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762321  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17781  PP family ATPase  39.34 
 
 
274 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2054  asparagine synthase  40.45 
 
 
317 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1028  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  39.77 
 
 
276 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1431  hypothetical protein  38.58 
 
 
267 aa  186  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3710  hypothetical protein  46.37 
 
 
274 aa  186  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.509319  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1214  PP-loop domain-containing protein  40.59 
 
 
265 aa  185  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20171  PP family ATPase  37.64 
 
 
280 aa  185  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1143  hypothetical protein  38.01 
 
 
280 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1000  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  40.38 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1595  ExsB family protein  41.85 
 
 
271 aa  183  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2185  hypothetical protein  39.02 
 
 
294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0147  ExsB family protein  41.92 
 
 
486 aa  178  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1060  PP-loop domain-containing protein  39.54 
 
 
276 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  42.69 
 
 
472 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31120  conserved hypothetical protein TIGR00268  39.1 
 
 
328 aa  175  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1718  hypothetical protein  38.82 
 
 
257 aa  175  8e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1558  hypothetical protein  41.46 
 
 
283 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6080  ExsB family protein  40.28 
 
 
283 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2185  hypothetical protein  35.97 
 
 
270 aa  168  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999968  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1704  PP-loop domain protein  34.59 
 
 
285 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0697664  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1003  hypothetical protein  37.4 
 
 
257 aa  160  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.309072  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0340  ExsB family protein  33.59 
 
 
265 aa  159  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1841  hypothetical protein  38.65 
 
 
265 aa  146  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0429  hypothetical protein  39.74 
 
 
295 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4914  ExsB family protein  37.26 
 
 
267 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1612  ExsB family protein  35.54 
 
 
257 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1357  hypothetical protein  35.47 
 
 
273 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  hitchhiker  0.00844883 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0368  hypothetical protein  33.73 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3008  hypothetical protein  31.56 
 
 
273 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2468  hypothetical protein  34.52 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000271324  hitchhiker  0.000588391 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1465  hypothetical protein  39.13 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.944037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3800  PP family ATPase  36.73 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104125  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1058  ExsB family protein  39.74 
 
 
210 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205582 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1434  ExsB family protein  29.84 
 
 
258 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.672941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0017  hypothetical protein  33.58 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000871636  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0485  ExsB family protein  28.91 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108747  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0352  PP-loop domain-containing protein  28.46 
 
 
258 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0092  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0553  hypothetical protein  26.36 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.757724  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0184  ExsB family protein  25.56 
 
 
279 aa  87  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_5288  predicted protein  33.7 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0250872  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  38.89 
 
 
552 aa  49.3  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  35.11 
 
 
546 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>