24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1080 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1080  ExsB family protein  100 
 
 
358 aa  737    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.420451  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1605  ExsB family protein  57.77 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1742  ExsB family protein  53.42 
 
 
303 aa  324  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1669  ExsB family protein  53.42 
 
 
303 aa  322  7e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0537  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.34 
 
 
322 aa  280  3e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.366098  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  30 
 
 
263 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2054  asparagine synthase  25.83 
 
 
317 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0177  tRNA methyl transferase-like protein  26.28 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  28.18 
 
 
263 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  37.33 
 
 
257 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  29.27 
 
 
283 aa  46.2  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2828  NAD+ synthetase  32.35 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0722  hypothetical protein  30.41 
 
 
272 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  37.33 
 
 
523 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  25.32 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3008  hypothetical protein  29.65 
 
 
273 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2603  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  26.14 
 
 
334 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.153014  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11710  NAD+ synthetase  25 
 
 
276 aa  43.9  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.996966  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  24.29 
 
 
588 aa  43.9  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1028  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  25.58 
 
 
276 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1431  hypothetical protein  29.14 
 
 
267 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1079  hypothetical protein  24.71 
 
 
279 aa  43.5  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  25.71 
 
 
594 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2185  hypothetical protein  27.61 
 
 
270 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999968  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>