More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1596 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  100 
 
 		 594 aa  1189    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  72.76 
 
 		 588 aa  868    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  76.09 
 
 		 594 aa  924    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  67.96 
 
 		 592 aa  854    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  39.11 
 
 		 614 aa  381  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.89 
 
 		 580 aa  282  1e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  31.6 
 
 		 634 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  29.95 
 
 		 633 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  32.92 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  35.97 
 
 		 469 aa  248  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  32.64 
 
 		 503 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  31.4 
 
 		 509 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  29.48 
 
 		 667 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  32.02 
 
 		 502 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  35.13 
 
 		 469 aa  233  6e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  32.18 
 
 		 466 aa  233  6e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  33.12 
 
 		 472 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  30.06 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  30.01 
 
 		 796 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  32.9 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  30.75 
 
 		 879 aa  192  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  35.22 
 
 		 878 aa  192  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.82 
 
 		 885 aa  184  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  32.97 
 
 		 880 aa  176  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  30.86 
 
 		 428 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  32.63 
 
 		 896 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  28.61 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  28.61 
 
 		 428 aa  164  6e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  28.61 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  27.4 
 
 		 441 aa  154  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.78 
 
 		 421 aa  150  9e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.3 
 
 		 784 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0799  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.44 
 
 		 755 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.19 
 
 		 723 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0796  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.06 
 
 		 256 aa  82  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5533  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.51 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.08 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0739  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.71 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00726569  normal  0.0134967 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0706  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  25.58 
 
 		 239 aa  75.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2290  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.22 
 
 		 237 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.67 
 
 		 248 aa  76.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.14 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1544  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.49 
 
 		 234 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.49 
 
 		 226 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.334965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.49 
 
 		 226 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25.49 
 
 		 234 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2192  phosophoadenylyl-sulfate reductase  26.32 
 
 		 243 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1147  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.9 
 
 		 256 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1777  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  29.13 
 
 		 238 aa  72.4  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1263  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  30.41 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1501  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  27.36 
 
 		 249 aa  72  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178392  normal  0.54749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1697  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.08 
 
 		 243 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224178  normal  0.181777 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1303  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3868  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25.49 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1582  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1344  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  26.47 
 
 		 234 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1300  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  29.02 
 
 		 227 aa  69.7  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.88984 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0962  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.05 
 
 		 238 aa  70.1  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000000110311  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1294  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.72 
 
 		 235 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2054  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  28.42 
 
 		 256 aa  69.7  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1476  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25 
 
 		 234 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1716  phosphoadenosine phosphosulfate reductase, putative  27.75 
 
 		 235 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2424  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  28.7 
 
 		 234 aa  69.3  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.238149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2110  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  30.11 
 
 		 240 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2535  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  27.4 
 
 		 239 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0413  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.94 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1863  Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  26.97 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4654  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  28.38 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550549  hitchhiker  0.00181688 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2786  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.64 
 
 		 244 aa  68.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952252 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  27.51 
 
 		 538 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2337  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  26.42 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  30.23 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1143  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.93 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.536652  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  28.87 
 
 		 551 aa  67  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  26.36 
 
 		 566 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.5 
 
 		 378 aa  67  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2615  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.88 
 
 		 233 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1669  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.78 
 
 		 241 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2969  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.86 
 
 		 244 aa  65.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  decreased coverage  0.00395562 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0049  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  24.17 
 
 		 241 aa  65.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3662  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.92 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.37 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1567  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.94 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.779448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0972  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.43 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3393  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.57 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2423  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.44 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1770  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.46 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.38524e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2468  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.08 
 
 		 240 aa  63.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.614171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2354  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.77 
 
 		 230 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0700983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1702  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.07 
 
 		 228 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2280  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.7 
 
 		 244 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0503527  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3551  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.06 
 
 		 244 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.34 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  26.39 
 
 		 484 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1862  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.46 
 
 		 249 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2473  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.46 
 
 		 249 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1582  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.02 
 
 		 243 aa  62  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356213  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2478  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.46 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2429  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25.5 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.149662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>