184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0790 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 		 784 aa  1622    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0799  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.32 
 
 		 755 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.31 
 
 		 723 aa  287  4e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  29.72 
 
 		 592 aa  154  7e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  30.83 
 
 		 588 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  30.3 
 
 		 594 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  31.36 
 
 		 594 aa  149  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  28.21 
 
 		 667 aa  126  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  26.84 
 
 		 633 aa  125  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  36.1 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  28.18 
 
 		 428 aa  120  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.59 
 
 		 580 aa  117  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  30.8 
 
 		 464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  29.81 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  25.06 
 
 		 634 aa  114  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  30.08 
 
 		 472 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  28 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  31.62 
 
 		 503 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  30.89 
 
 		 469 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  30.8 
 
 		 502 aa  111  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  26.78 
 
 		 614 aa  110  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  31.2 
 
 		 512 aa  109  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  28.95 
 
 		 466 aa  107  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  25.39 
 
 		 796 aa  107  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  27.64 
 
 		 428 aa  107  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.3 
 
 		 885 aa  107  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  29.49 
 
 		 509 aa  104  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  28.89 
 
 		 441 aa  95.9  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  29.19 
 
 		 491 aa  95.1  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  27.36 
 
 		 878 aa  92  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  25.68 
 
 		 879 aa  87.4  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  27.52 
 
 		 880 aa  84.3  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.35 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2192  phosophoadenylyl-sulfate reductase  28.08 
 
 		 243 aa  73.9  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  27.69 
 
 		 896 aa  73.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.55 
 
 		 226 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.334965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.55 
 
 		 226 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.91 
 
 		 238 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1582  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  27.55 
 
 		 234 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1303  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.55 
 
 		 234 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.27 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  27.04 
 
 		 234 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.53 
 
 		 248 aa  70.5  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1294  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.08 
 
 		 235 aa  69.7  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0413  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.57 
 
 		 235 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1344  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.84 
 
 		 234 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5533  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.26 
 
 		 224 aa  69.7  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1143  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.8 
 
 		 234 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.536652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3868  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  27.32 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1476  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  27.32 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  28.82 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1544  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.02 
 
 		 234 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5316  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.51 
 
 		 342 aa  67.4  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1300  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  24.76 
 
 		 227 aa  66.6  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.88984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2969  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.47 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  decreased coverage  0.00395562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3089  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.64 
 
 		 234 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00612825  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0739  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.7 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00726569  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3393  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.44 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.11 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0006  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  31.06 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000392553  hitchhiker  0.000000249186 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.7 
 
 		 257 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2535  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  29.24 
 
 		 239 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1770  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.91 
 
 		 236 aa  56.2  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.38524e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1409  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30 
 
 		 239 aa  56.2  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.483599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.23 
 
 		 363 aa  56.6  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12420  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.05 
 
 		 254 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.97 
 
 		 319 aa  55.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0604  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.14 
 
 		 218 aa  55.1  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1226  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  26.4 
 
 		 234 aa  53.9  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0928786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1697  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.88 
 
 		 243 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224178  normal  0.181777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.59 
 
 		 256 aa  53.9  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.27 
 
 		 267 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.32 
 
 		 378 aa  53.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.12 
 
 		 234 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1702  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.67 
 
 		 228 aa  52.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1889  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.14 
 
 		 260 aa  52.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2290  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.28 
 
 		 237 aa  52.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2356  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  23.7 
 
 		 268 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2054  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  23.7 
 
 		 256 aa  52.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.83 
 
 		 279 aa  52.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1786  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  25.99 
 
 		 241 aa  52.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0517285  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2110  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  24.16 
 
 		 240 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3265  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.32 
 
 		 258 aa  52.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242292  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2468  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.31 
 
 		 240 aa  52.4  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.614171  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  29.85 
 
 		 495 aa  52  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1263  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  26.18 
 
 		 245 aa  52  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.17 
 
 		 246 aa  52  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2858  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  24.65 
 
 		 235 aa  51.6  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0023107  hitchhiker  0.0000184326 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5428  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.26 
 
 		 277 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4654  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  27.81 
 
 		 252 aa  51.2  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550549  hitchhiker  0.00181688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1642  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), adenylyl-sulfate kinase  25.13 
 
 		 462 aa  51.2  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2280  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.49 
 
 		 244 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0503527  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3317  translation initiation factor IF-2  29.24 
 
 		 222 aa  51.2  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0935287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1147  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.56 
 
 		 256 aa  50.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1772  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  26.14 
 
 		 237 aa  50.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1301  hypothetical protein  27.33 
 
 		 339 aa  50.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0667  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.49 
 
 		 250 aa  50.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000389799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  25.45 
 
 		 507 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1561  adenylylsulfate reductase thioredoxin dependent  23.81 
 
 		 250 aa  49.7  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1501  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  26.88 
 
 		 236 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>