69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4585 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
279 aa  580  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1182  putative phage-related protein  71.79 
 
 
280 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.225996  normal  0.11373 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0173  putative phage-related protein  71.79 
 
 
280 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000630983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.42 
 
 
276 aa  274  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.6 
 
 
278 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.64 
 
 
298 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5329  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.4 
 
 
278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.176217 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.44 
 
 
257 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0637  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.49 
 
 
270 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.899373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4046  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.15 
 
 
368 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3011  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.95 
 
 
368 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11209  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00122  putative phage-related protein  39.87 
 
 
350 aa  133  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  26.96 
 
 
428 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  26.47 
 
 
428 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  26.34 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  24.39 
 
 
428 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  27.23 
 
 
441 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.27 
 
 
421 aa  58.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  27.36 
 
 
592 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.4 
 
 
319 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4093  hypothetical protein  26.36 
 
 
322 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0520376  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  28.84 
 
 
633 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1211  putative phage-related protein  24.9 
 
 
280 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  26.34 
 
 
667 aa  53.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.38 
 
 
580 aa  53.1  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.51 
 
 
334 aa  52.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.83 
 
 
784 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  23.74 
 
 
796 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  26.77 
 
 
634 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  30.51 
 
 
509 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1652  hypothetical protein  24 
 
 
280 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  23.53 
 
 
466 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.53 
 
 
336 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0136042  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0249  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.18 
 
 
290 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.819659  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0627  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  28.97 
 
 
290 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0745757  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.04 
 
 
430 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0220762  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.64 
 
 
723 aa  49.7  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1365  gp51  23.05 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  26.22 
 
 
469 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  34.02 
 
 
464 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  26.5 
 
 
588 aa  48.5  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.62 
 
 
363 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0661  hypothetical protein  25.46 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.674805 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  26.7 
 
 
878 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  27.14 
 
 
594 aa  47  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.73 
 
 
885 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  26.48 
 
 
512 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  27 
 
 
594 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2827  hypothetical protein  24.04 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.556996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2431  putative phage-related protein  22.52 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  25.34 
 
 
491 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  28.17 
 
 
538 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8682  hypothetical protein  23.33 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  22.61 
 
 
469 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.18 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  26.25 
 
 
495 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  24.81 
 
 
879 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  26.9 
 
 
588 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  26.13 
 
 
503 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  26 
 
 
551 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  30.26 
 
 
507 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  27.27 
 
 
566 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  28.78 
 
 
544 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  26.53 
 
 
541 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3838  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.75 
 
 
408 aa  42.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0614264  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  25.89 
 
 
502 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1030  gp57  21.5 
 
 
332 aa  42.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  26.49 
 
 
391 aa  42.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  32.61 
 
 
880 aa  42.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>