50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4214 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 		 284 aa  595  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5428  hypothetical protein  31.54 
 
 		 404 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.88 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.39 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0336  hypothetical protein  32.81 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1365  gp51  33.08 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.75 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0220762  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  24.78 
 
 		 592 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.34 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0136042  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.11 
 
 		 723 aa  58.9  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.27 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3838  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.95 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0614264  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  27.18 
 
 		 633 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4322  hypothetical protein  30.84 
 
 		 348 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.2 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1301  hypothetical protein  27.83 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.59 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4126  hypothetical protein  26.21 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  25.56 
 
 		 588 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  26.24 
 
 		 634 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0006  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  30.22 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000392553  hitchhiker  0.000000249186 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  22.22 
 
 		 428 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5004  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.09 
 
 		 346 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  0.549509 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  25.13 
 
 		 594 aa  48.9  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  21.26 
 
 		 428 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  21.13 
 
 		 428 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  27.93 
 
 		 509 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  21.74 
 
 		 428 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2724  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.49 
 
 		 387 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.548839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.87 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  24.4 
 
 		 594 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5329  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.53 
 
 		 278 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.176217 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.76 
 
 		 784 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1030  gp57  32.86 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818193  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0637  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.899373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  25.54 
 
 		 588 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.18 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  22.44 
 
 		 441 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  24.15 
 
 		 600 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1725  hypothetical protein  26.83 
 
 		 491 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  0.95658 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  24.32 
 
 		 502 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.5 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  27.14 
 
 		 469 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0153  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.66 
 
 		 353 aa  42.7  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1652  hypothetical protein  28.35 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30 
 
 		 392 aa  42.7  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.11 
 
 		 421 aa  42.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0173  putative phage-related protein  27.31 
 
 		 280 aa  42  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000630983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1182  putative phage-related protein  27.31 
 
 		 280 aa  42  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.225996  normal  0.11373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>