27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5004 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_5004  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 		 346 aa  715    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  0.549509 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0336  hypothetical protein  60.76 
 
 		 341 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4322  hypothetical protein  54.24 
 
 		 348 aa  359  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1301  hypothetical protein  56.52 
 
 		 339 aa  358  7e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2724  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.91 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.548839 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0006  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  44.92 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000392553  hitchhiker  0.000000249186 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4126  hypothetical protein  44.5 
 
 		 213 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4117  hypothetical protein  48.7 
 
 		 165 aa  149  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.53 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  22.35 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3838  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.45 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0614264  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  21.18 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.45 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0136042  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  21.88 
 
 		 428 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.73 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  23.91 
 
 		 428 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.17 
 
 		 430 aa  49.7  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0220762  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  28.68 
 
 		 594 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.09 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1365  gp51  25.95 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.08 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5428  hypothetical protein  25.59 
 
 		 404 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.39 
 
 		 784 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1030  gp57  33.85 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818193  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  21.2 
 
 		 441 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  23.05 
 
 		 469 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  24.29 
 
 		 614 aa  43.1  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>