157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3838 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3838  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
408 aa  853    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0614264  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  86.32 
 
 
336 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0136042  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  80.34 
 
 
334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.49 
 
 
363 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1030  gp57  38.74 
 
 
332 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818193  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1365  gp51  37.96 
 
 
373 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.12 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.08 
 
 
430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0220762  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0717  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.85 
 
 
303 aa  63.5  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.528578  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1301  hypothetical protein  33.93 
 
 
339 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1226  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  44.44 
 
 
234 aa  58.9  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0928786  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5004  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.45 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  0.549509 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.95 
 
 
284 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  32.09 
 
 
879 aa  57.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1147  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.57 
 
 
256 aa  57  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2423  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.19 
 
 
267 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0006  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  27.78 
 
 
327 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000392553  hitchhiker  0.000000249186 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0336  hypothetical protein  25.91 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4654  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  35.71 
 
 
252 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550549  hitchhiker  0.00181688 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1567  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.5 
 
 
224 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.779448  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2615  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  28.47 
 
 
233 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1263  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  41.43 
 
 
245 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405389  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  27.52 
 
 
428 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2110  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  41.79 
 
 
240 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1777  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  33.03 
 
 
238 aa  53.9  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138147  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  27.46 
 
 
428 aa  53.5  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4322  hypothetical protein  28.57 
 
 
348 aa  53.1  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.37 
 
 
220 aa  53.1  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238936  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  27.46 
 
 
428 aa  53.1  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2227  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.72 
 
 
271 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0661  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.38 
 
 
274 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.143312 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2687  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.1 
 
 
267 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.966283  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  26.76 
 
 
428 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7377  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  36.76 
 
 
246 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833436  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2814  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.88 
 
 
266 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00991854  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  31.11 
 
 
472 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0559  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  31.53 
 
 
258 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.639085  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1801  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  32.65 
 
 
264 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803046  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0182  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.71 
 
 
252 aa  51.6  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1770  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.57 
 
 
236 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.38524e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2560  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.44 
 
 
270 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1862  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.43 
 
 
249 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  29.14 
 
 
251 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2473  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.43 
 
 
249 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1697  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.86 
 
 
243 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224178  normal  0.181777 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0176  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.71 
 
 
252 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2390  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.04 
 
 
249 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.98 
 
 
580 aa  50.8  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1237  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  35.96 
 
 
231 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0431242  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2478  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.43 
 
 
250 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2522  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.43 
 
 
249 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2290  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.3 
 
 
237 aa  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2858  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  31.25 
 
 
235 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0023107  hitchhiker  0.0000184326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0796  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.14 
 
 
256 aa  50.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0882  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  29.73 
 
 
258 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002352  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  32.18 
 
 
259 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000919211  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2246  adenylylsulfate reductase  34.94 
 
 
241 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.445437  normal  0.0256026 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5804  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.31 
 
 
250 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0390332 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0816  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.04 
 
 
249 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50151  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1118  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.93 
 
 
249 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1072  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  36.78 
 
 
241 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.069664  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4126  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12820  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  40.3 
 
 
233 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3935  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  33.33 
 
 
231 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0181  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.42 
 
 
242 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000573996 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0821  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.77 
 
 
247 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5481  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  32.65 
 
 
263 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1300  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  34.72 
 
 
227 aa  48.5  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.88984 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.65 
 
 
885 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.75 
 
 
278 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2685  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.58 
 
 
240 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2200  Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  30.39 
 
 
239 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.096364  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2772  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.13 
 
 
240 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2233  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.45 
 
 
246 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0771  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  28.83 
 
 
252 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.264315 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00003  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.18 
 
 
259 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2694  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.14 
 
 
266 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3330  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  28.57 
 
 
241 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0855113 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  31.25 
 
 
633 aa  47.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  28.57 
 
 
441 aa  47.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  27.54 
 
 
880 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3475  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.26 
 
 
231 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2510  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  34.52 
 
 
269 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.949973  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3538  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.26 
 
 
231 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.26 
 
 
231 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0477  Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  29.27 
 
 
192 aa  47.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.655692  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5428  hypothetical protein  34.4 
 
 
404 aa  47  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572608  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.91 
 
 
268 aa  47  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2192  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  34.52 
 
 
269 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245499  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2234  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  34.52 
 
 
269 aa  47  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0527  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.08 
 
 
223 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277121  normal  0.296844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1155  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.63 
 
 
248 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4113  Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  31.43 
 
 
250 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25 
 
 
784 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2535  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  31.37 
 
 
239 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1501  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  31.43 
 
 
236 aa  46.6  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2914  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30 
 
 
239 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1669  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.37 
 
 
241 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400633  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3858  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.05 
 
 
232 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0787584 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2346  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.45 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>