More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002352 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002352  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  100 
 
 
259 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000919211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00003  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  91.51 
 
 
259 aa  497  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0404  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  76.98 
 
 
253 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00412674  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2797  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  79.08 
 
 
253 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000737021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3064  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  77.27 
 
 
244 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.696985  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02607  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  76.86 
 
 
244 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0926  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  76.86 
 
 
244 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2902  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  77.27 
 
 
244 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02570  hypothetical protein  76.86 
 
 
244 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3113  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  77.27 
 
 
244 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0950  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  76.86 
 
 
244 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4016  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  76.03 
 
 
244 aa  391  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.634763  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3258  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  75.62 
 
 
244 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2890  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  76.86 
 
 
244 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3100  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  76.03 
 
 
244 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.337134  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3076  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  75.62 
 
 
244 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3157  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  75.62 
 
 
244 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.267465 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3141  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  75.62 
 
 
244 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3225  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.7 
 
 
244 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3525  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  74.38 
 
 
244 aa  377  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130078  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0829  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  73.55 
 
 
244 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3363  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  74.38 
 
 
244 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3436  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  69.41 
 
 
254 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  hitchhiker  0.0011712 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0812  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  71.9 
 
 
244 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  70.66 
 
 
244 aa  367  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  70.66 
 
 
244 aa  367  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0860  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  69.83 
 
 
244 aa  361  5.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0934  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.94 
 
 
259 aa  347  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0636738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.92 
 
 
263 aa  347  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0921  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.73 
 
 
260 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0946  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.73 
 
 
260 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.896078  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0955  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.32 
 
 
260 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3414  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.92 
 
 
260 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0216  phosophoadenylyl-sulfate reductase  64.73 
 
 
245 aa  341  7e-93  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3078  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.26 
 
 
265 aa  339  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0857  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.26 
 
 
265 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3062  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.63 
 
 
260 aa  338  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0894  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.85 
 
 
265 aa  337  9e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3736  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.39 
 
 
245 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.53 
 
 
242 aa  334  7e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0667  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.97 
 
 
250 aa  331  6e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000389799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  68.61 
 
 
248 aa  331  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0655  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.97 
 
 
251 aa  330  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3805  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.89 
 
 
255 aa  322  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.103043 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.98 
 
 
256 aa  317  7.999999999999999e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0778  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.25 
 
 
260 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595511  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.5 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2114  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  60.54 
 
 
245 aa  300  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.38 
 
 
237 aa  294  8e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.38 
 
 
253 aa  294  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0750  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.38 
 
 
237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0260  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.85 
 
 
295 aa  238  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.43 
 
 
273 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.03 
 
 
267 aa  223  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.21 
 
 
232 aa  223  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4543  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.39 
 
 
293 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.591012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2865  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.28 
 
 
240 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.574909 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02591  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.61 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00901  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.07 
 
 
255 aa  185  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.800152  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01461  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.1 
 
 
256 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0384  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.11 
 
 
266 aa  180  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.83 
 
 
248 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.727681 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1445  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.73 
 
 
255 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.4 
 
 
240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00911  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.19 
 
 
241 aa  171  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.65 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0084  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 
241 aa  161  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.650501  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3311  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.09 
 
 
234 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.55 
 
 
241 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3330  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  31.74 
 
 
241 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0855113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.91 
 
 
285 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03860  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), putative  33.05 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  37.5 
 
 
234 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  35.17 
 
 
251 aa  128  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2054  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  32.19 
 
 
256 aa  126  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12820  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  33.05 
 
 
233 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.84 
 
 
234 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2427  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  35.27 
 
 
206 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.48 
 
 
248 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7377  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  33.63 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833436  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2560  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.19 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.96 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0717  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.73 
 
 
303 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.528578  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3794  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  31.51 
 
 
282 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0253672  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3858  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.47 
 
 
232 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0787584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1395  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.28 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1077  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.95 
 
 
263 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2431  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  33.48 
 
 
219 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1679  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  36 
 
 
206 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.654918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2772  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  32.07 
 
 
240 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4056  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.89 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.957521  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3992  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.29 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.56 
 
 
231 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3475  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.56 
 
 
231 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3538  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.56 
 
 
231 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3703  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.18 
 
 
256 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1786  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  33.79 
 
 
241 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0517285  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2685  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.29 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.59 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.78 
 
 
248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.54974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>