More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3141 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3141  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
244 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.682 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3258  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  99.59 
 
 
244 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3100  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  98.77 
 
 
244 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.337134  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3076  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  98.77 
 
 
244 aa  497  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3157  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  97.95 
 
 
244 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.267465 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02607  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  93.85 
 
 
244 aa  477  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0926  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  93.85 
 
 
244 aa  477  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518681  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0950  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  93.85 
 
 
244 aa  477  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02570  hypothetical protein  93.85 
 
 
244 aa  477  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3113  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  93.44 
 
 
244 aa  476  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2902  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  93.44 
 
 
244 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4016  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  93.85 
 
 
244 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.634763  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2890  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  93.44 
 
 
244 aa  474  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3064  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  93.03 
 
 
244 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.696985  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3225  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  91.39 
 
 
244 aa  444  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3363  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  83.61 
 
 
244 aa  431  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0812  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  81.56 
 
 
244 aa  427  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  79.92 
 
 
244 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3525  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  81.56 
 
 
244 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130078  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  79.92 
 
 
244 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0829  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  80.33 
 
 
244 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0860  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.28 
 
 
244 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002352  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  77.97 
 
 
259 aa  381  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000919211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00003  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  72.73 
 
 
259 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0216  phosophoadenylyl-sulfate reductase  72.84 
 
 
245 aa  375  1e-103  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2797  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  71.85 
 
 
253 aa  361  5.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000737021  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0404  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.49 
 
 
253 aa  355  5e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00412674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3436  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.94 
 
 
254 aa  343  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  hitchhiker  0.0011712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0934  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  68.26 
 
 
259 aa  332  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0636738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.4 
 
 
263 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.6 
 
 
242 aa  325  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0667  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.46 
 
 
250 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000389799 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3736  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.46 
 
 
245 aa  323  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.52 
 
 
248 aa  323  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0894  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.05 
 
 
265 aa  322  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0857  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.05 
 
 
265 aa  321  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3078  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.05 
 
 
265 aa  321  6e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0921  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.22 
 
 
260 aa  321  7e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0946  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.81 
 
 
260 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.896078  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3062  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.4 
 
 
260 aa  319  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0655  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.14 
 
 
251 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3414  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.4 
 
 
260 aa  317  9e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0955  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.4 
 
 
260 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.92 
 
 
241 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0778  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.28 
 
 
260 aa  311  9e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595511  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.77 
 
 
256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3805  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.5 
 
 
255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.103043 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2114  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  62.45 
 
 
245 aa  302  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.49 
 
 
237 aa  292  3e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0750  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.9 
 
 
237 aa  289  4e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.3 
 
 
253 aa  284  7e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0260  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.98 
 
 
295 aa  242  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.54 
 
 
273 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52 
 
 
232 aa  239  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4543  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.53 
 
 
293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.591012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.36 
 
 
267 aa  227  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2865  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.03 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.574909 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02591  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.85 
 
 
266 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.78 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.727681 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00901  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.09 
 
 
255 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.800152  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00911  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.52 
 
 
241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01461  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.1 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1445  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.68 
 
 
255 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0384  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.78 
 
 
266 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.22 
 
 
240 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0084  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.03 
 
 
241 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.650501  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 
240 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3311  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.47 
 
 
234 aa  142  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3330  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  34.21 
 
 
241 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0855113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.12 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03860  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), putative  37.34 
 
 
272 aa  134  9e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.96 
 
 
248 aa  131  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.81 
 
 
241 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  38.69 
 
 
234 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2054  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  32.19 
 
 
256 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5533  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.23 
 
 
224 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2427  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  35.24 
 
 
206 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  36.04 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.07 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.46 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1077  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.41 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3794  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  31.76 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0253672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1344  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  35.62 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0344  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  34.07 
 
 
374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  35.62 
 
 
234 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2615  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  36.48 
 
 
233 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3868  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  34.91 
 
 
234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2560  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.86 
 
 
268 aa  115  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1303  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.62 
 
 
234 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1582  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  35.62 
 
 
234 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1544  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.62 
 
 
234 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2431  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  33.48 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1143  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.536652  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0049  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  33.79 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1679  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  34.67 
 
 
206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.654918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3858  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.94 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0787584 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1476  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  34.05 
 
 
234 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7377  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  35.53 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833436  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12820  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  32.74 
 
 
233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>