More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3062 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3062  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
260 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0921  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  93.46 
 
 
260 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3414  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  93.85 
 
 
260 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0946  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  93.08 
 
 
260 aa  507  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.896078  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0955  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  91.54 
 
 
260 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3078  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  86.04 
 
 
265 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0857  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  86.04 
 
 
265 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0894  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  85.66 
 
 
265 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3736  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  89.8 
 
 
245 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0667  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  83.4 
 
 
250 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000389799 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  81.03 
 
 
263 aa  434  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0934  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  82.93 
 
 
259 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0636738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0655  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  79.76 
 
 
251 aa  421  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3805  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.66 
 
 
255 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.103043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0778  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  80.08 
 
 
260 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595511  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.9 
 
 
242 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2797  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.82 
 
 
253 aa  348  6e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000737021  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00003  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.41 
 
 
259 aa  330  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.9 
 
 
248 aa  327  9e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002352  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  66.81 
 
 
259 aa  326  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000919211  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3436  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.56 
 
 
254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  hitchhiker  0.0011712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3363  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.82 
 
 
244 aa  326  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0829  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.22 
 
 
244 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3258  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.4 
 
 
244 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.37 
 
 
256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3100  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.4 
 
 
244 aa  319  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.337134  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3141  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.4 
 
 
244 aa  319  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.682 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3076  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.4 
 
 
244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3157  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.4 
 
 
244 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.267465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3525  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.14 
 
 
244 aa  316  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130078  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02607  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.74 
 
 
244 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3113  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.74 
 
 
244 aa  315  4e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0404  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.61 
 
 
253 aa  315  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00412674  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.22 
 
 
244 aa  315  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480804  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02570  hypothetical protein  60.74 
 
 
244 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2902  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.74 
 
 
244 aa  315  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.22 
 
 
244 aa  315  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3064  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.74 
 
 
244 aa  315  6e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.696985  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0926  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.74 
 
 
244 aa  315  7e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518681  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4016  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.74 
 
 
244 aa  315  7e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.634763  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0950  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.74 
 
 
244 aa  315  7e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2890  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.74 
 
 
244 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3225  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.48 
 
 
244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0812  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.92 
 
 
244 aa  311  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0216  phosophoadenylyl-sulfate reductase  60.42 
 
 
245 aa  308  5e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0860  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.48 
 
 
244 aa  308  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2114  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  61.43 
 
 
245 aa  304  8.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.73 
 
 
237 aa  296  2e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.51 
 
 
241 aa  294  9e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0750  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.73 
 
 
237 aa  292  4e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.64 
 
 
253 aa  289  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0260  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.65 
 
 
295 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.21 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.13 
 
 
232 aa  229  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4543  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.03 
 
 
293 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.591012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.67 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2865  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.02 
 
 
240 aa  204  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.574909 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.91 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.727681 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02591  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.65 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00901  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.93 
 
 
255 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.800152  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0384  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.46 
 
 
266 aa  193  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.46 
 
 
240 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.67 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00911  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.12 
 
 
241 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0084  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.11 
 
 
241 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.650501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01461  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.34 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1445  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.51 
 
 
255 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.51 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.2 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_004310  BR0182  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.2 
 
 
252 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1077  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.24 
 
 
263 aa  125  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.47 
 
 
268 aa  125  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0176  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.77 
 
 
252 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3330  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  30.26 
 
 
241 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0855113 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3311  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.74 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.18 
 
 
249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1152  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.48 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4056  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.43 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.957521  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1395  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  37.62 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3128  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.32 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.377353 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.6 
 
 
248 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.27 
 
 
246 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  33.19 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03860  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), putative  32.77 
 
 
272 aa  115  8.999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1772  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  33.82 
 
 
237 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2468  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.05 
 
 
240 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.614171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2054  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  30.93 
 
 
256 aa  112  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49723  predicted protein  31.9 
 
 
264 aa  112  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0783977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1759  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.24 
 
 
253 aa  111  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3992  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.84 
 
 
245 aa  111  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2777  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.42 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278239  normal  0.0478398 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0344  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  33.17 
 
 
374 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5533  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.34 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.55 
 
 
234 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.17 
 
 
234 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04770  Phosphoadenosine phosphosulfate reductase (EC 1.8.4.8)(PAPS reductase, thioredoxin dependent)(PAdoPS reductase)(3'-phosphoadenylylsulfate reductase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P56859]  35.05 
 
 
324 aa  108  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  33.5 
 
 
234 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.33 
 
 
238 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0592  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.33 
 
 
251 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>