More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3805 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3805  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
255 aa  524  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.103043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0778  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  88.38 
 
 
260 aa  448  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595511  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0655  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  82.26 
 
 
251 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0921  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  77.87 
 
 
260 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3062  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.66 
 
 
260 aa  420  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3414  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.26 
 
 
260 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0955  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  77.47 
 
 
260 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0667  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  80.57 
 
 
250 aa  418  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000389799 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0946  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  77.47 
 
 
260 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.896078  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3078  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  77.51 
 
 
265 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  77.51 
 
 
263 aa  408  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0857  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  77.51 
 
 
265 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3736  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  77.96 
 
 
245 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0894  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  77.11 
 
 
265 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0934  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  76.52 
 
 
259 aa  401  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0636738  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  75.53 
 
 
242 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2797  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.29 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000737021  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00003  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.48 
 
 
259 aa  320  9.000000000000001e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0829  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.04 
 
 
244 aa  314  9e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0404  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.5 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00412674  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002352  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  63.16 
 
 
259 aa  310  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000919211  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3436  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.09 
 
 
254 aa  310  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  hitchhiker  0.0011712 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0860  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.03 
 
 
244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.9 
 
 
256 aa  308  8e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02607  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.92 
 
 
244 aa  307  9e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02570  hypothetical protein  59.92 
 
 
244 aa  307  9e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.33 
 
 
244 aa  306  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.33 
 
 
244 aa  306  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480804  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3113  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.92 
 
 
244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2902  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.92 
 
 
244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0926  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.5 
 
 
244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518681  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3157  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.09 
 
 
244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.267465 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3141  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.5 
 
 
244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.682 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3363  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.76 
 
 
244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3258  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.5 
 
 
244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0950  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.5 
 
 
244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0812  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.03 
 
 
244 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3064  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.92 
 
 
244 aa  305  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.696985  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3076  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.5 
 
 
244 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3225  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.3 
 
 
244 aa  304  7e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2890  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.5 
 
 
244 aa  305  7e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3100  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.5 
 
 
244 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.337134  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4016  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.09 
 
 
244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.634763  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.89 
 
 
248 aa  301  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3525  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.49 
 
 
244 aa  298  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130078  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0216  phosophoadenylyl-sulfate reductase  57.2 
 
 
245 aa  291  7e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.5 
 
 
241 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2114  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  59.19 
 
 
245 aa  289  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.73 
 
 
237 aa  289  4e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0750  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.73 
 
 
237 aa  285  4e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.18 
 
 
253 aa  284  8e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.39 
 
 
273 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0260  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  55.95 
 
 
295 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.44 
 
 
232 aa  234  7e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.32 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4543  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.47 
 
 
293 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.591012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2865  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.26 
 
 
240 aa  208  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.574909 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02591  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.68 
 
 
266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.25 
 
 
248 aa  196  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.727681 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00901  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.92 
 
 
255 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.800152  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.67 
 
 
240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.67 
 
 
240 aa  178  9e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00911  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.72 
 
 
241 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0384  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.82 
 
 
266 aa  175  8e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1445  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.11 
 
 
255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01461  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.11 
 
 
256 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0084  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.44 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.650501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3330  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  30.17 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0855113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.38 
 
 
241 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1077  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.21 
 
 
263 aa  125  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  38.81 
 
 
234 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.19 
 
 
285 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.33 
 
 
248 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3311  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.21 
 
 
234 aa  122  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1395  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.21 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2054  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  30.47 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  33.47 
 
 
251 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03860  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), putative  31.13 
 
 
272 aa  115  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.32 
 
 
268 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.02 
 
 
234 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1152  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 
251 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.44 
 
 
251 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0256913  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0592  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.82 
 
 
251 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.82 
 
 
238 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34 
 
 
249 aa  111  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0182  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.5 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49723  predicted protein  31.98 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0783977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3794  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  29.37 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0253672  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3992  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.17 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1759  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.83 
 
 
253 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2468  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.81 
 
 
240 aa  109  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.614171  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1772  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  33.76 
 
 
237 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0176  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33 
 
 
252 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0706  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  28.15 
 
 
239 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.12 
 
 
246 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2560  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.27 
 
 
270 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4056  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.17 
 
 
254 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.957521  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0656  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.34 
 
 
243 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2777  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.35 
 
 
252 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278239  normal  0.0478398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2615  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  29.91 
 
 
233 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>