More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2506 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
232 aa  480  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4543  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  69.78 
 
 
293 aa  340  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.591012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.56 
 
 
273 aa  337  9e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0260  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.11 
 
 
295 aa  336  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.11 
 
 
267 aa  327  9e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2865  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.67 
 
 
240 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.574909 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.88 
 
 
248 aa  250  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.727681 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00911  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.02 
 
 
241 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00901  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.1 
 
 
255 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.800152  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02591  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.86 
 
 
266 aa  248  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2114  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  53.25 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1445  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.5 
 
 
255 aa  241  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01461  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.5 
 
 
256 aa  241  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0667  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.12 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000389799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3157  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52 
 
 
244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.267465 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3141  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52 
 
 
244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.682 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3258  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52 
 
 
244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.67 
 
 
242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0812  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.67 
 
 
244 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3100  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52 
 
 
244 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.337134  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3076  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52 
 
 
244 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02607  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.56 
 
 
244 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0778  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.44 
 
 
260 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595511  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02570  hypothetical protein  51.56 
 
 
244 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.88 
 
 
263 aa  236  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0860  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.11 
 
 
244 aa  236  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.56 
 
 
244 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480804  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.56 
 
 
244 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.5 
 
 
237 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3736  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.23 
 
 
245 aa  235  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3113  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.11 
 
 
244 aa  235  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2902  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.11 
 
 
244 aa  235  6e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3805  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.44 
 
 
255 aa  234  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.103043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0655  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.45 
 
 
251 aa  234  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3064  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.11 
 
 
244 aa  234  7e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.696985  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.93 
 
 
240 aa  234  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.78 
 
 
256 aa  234  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0926  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.67 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518681  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0384  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.85 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2890  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.67 
 
 
244 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0950  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.67 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.74 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0894  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.34 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0750  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.5 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.33 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0829  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.43 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4016  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.67 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.634763  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3078  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.34 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0857  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.34 
 
 
265 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0084  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.81 
 
 
241 aa  231  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.650501  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0934  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.34 
 
 
259 aa  231  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0636738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3062  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.13 
 
 
260 aa  229  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3225  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.22 
 
 
244 aa  229  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0946  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50 
 
 
260 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.896078  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0921  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50 
 
 
260 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.44 
 
 
248 aa  228  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3414  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50 
 
 
260 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3363  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.11 
 
 
244 aa  228  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2797  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50 
 
 
253 aa  226  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000737021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0955  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.55 
 
 
260 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3436  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.78 
 
 
254 aa  225  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  hitchhiker  0.0011712 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.73 
 
 
240 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3525  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.55 
 
 
244 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130078  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002352  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  48.21 
 
 
259 aa  222  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000919211  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0216  phosophoadenylyl-sulfate reductase  47.11 
 
 
245 aa  219  3e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00003  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.43 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0404  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.2 
 
 
253 aa  200  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00412674  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.96 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.65 
 
 
285 aa  148  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.78 
 
 
241 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3311  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.5 
 
 
234 aa  136  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2431  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  35.22 
 
 
219 aa  135  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3330  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  31.88 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0855113 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2054  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  34.03 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2545  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  34.5 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153646 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1344  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  33.18 
 
 
234 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1679  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  36.4 
 
 
206 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.654918 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2427  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  35.21 
 
 
206 aa  128  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03860  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), putative  34.47 
 
 
272 aa  128  9.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3794  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  34.76 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0253672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3868  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  33.33 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1294  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.84 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5165  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.68 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3265  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.22 
 
 
258 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242292  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1476  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  32.88 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1544  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 
234 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  32.88 
 
 
234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  33.63 
 
 
234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.61 
 
 
234 aa  125  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  34.67 
 
 
251 aa  125  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1303  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.42 
 
 
234 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1582  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  32.42 
 
 
234 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.42 
 
 
234 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1772  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  36.07 
 
 
237 aa  121  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0311  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  36 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.1 
 
 
246 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.96 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.334965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.96 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.05 
 
 
238 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.05 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>