247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2545 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2545  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  100 
 
 
206 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153646 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1679  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  84.95 
 
 
206 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.654918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2406  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  80.88 
 
 
210 aa  350  8.999999999999999e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137644  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0311  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  80 
 
 
207 aa  350  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2427  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  75.24 
 
 
206 aa  337  7e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1793  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  76.85 
 
 
213 aa  337  8e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.14223  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1929  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  76.35 
 
 
213 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.241785  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1108  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  54.41 
 
 
209 aa  245  4e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1066  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  55.45 
 
 
212 aa  241  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1396  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  54.46 
 
 
212 aa  241  7e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06005  possible 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  49.74 
 
 
204 aa  206  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.710994  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2431  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  49.49 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0260  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.96 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.96 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.24 
 
 
267 aa  132  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.5 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.99 
 
 
241 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4543  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.65 
 
 
293 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.591012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2865  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.17 
 
 
240 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.574909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02607  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.02 
 
 
244 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02570  hypothetical protein  34.02 
 
 
244 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0926  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.61 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518681  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3113  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.61 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2902  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.61 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0950  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.61 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3157  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.61 
 
 
244 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.267465 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4016  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.61 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.634763  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3141  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.61 
 
 
244 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.682 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2890  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.61 
 
 
244 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3064  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.61 
 
 
244 aa  111  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.696985  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3258  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.61 
 
 
244 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.3 
 
 
237 aa  111  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3436  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.95 
 
 
254 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  hitchhiker  0.0011712 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0750  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.84 
 
 
237 aa  111  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002352  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  34.3 
 
 
259 aa  111  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000919211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.32 
 
 
248 aa  111  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3076  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.61 
 
 
244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00003  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.74 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3100  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.2 
 
 
244 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.337134  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36 
 
 
263 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0934  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.96 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0636738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0667  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.78 
 
 
250 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000389799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0778  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.79 
 
 
260 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595511  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3078  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.31 
 
 
265 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0857  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.31 
 
 
265 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2797  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.5 
 
 
253 aa  104  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000737021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0812  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.95 
 
 
244 aa  104  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.92 
 
 
253 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3805  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.83 
 
 
255 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.103043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3736  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.58 
 
 
245 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.71 
 
 
242 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0894  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36 
 
 
265 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3062  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.31 
 
 
260 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0404  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.56 
 
 
253 aa  101  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00412674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.78 
 
 
256 aa  101  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.9 
 
 
244 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480804  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3225  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.38 
 
 
244 aa  101  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.9 
 
 
244 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  32.39 
 
 
234 aa  101  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2114  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  36.71 
 
 
245 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0829  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.98 
 
 
244 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0655  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.29 
 
 
251 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0946  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.01 
 
 
260 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.896078  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3525  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.13 
 
 
244 aa  99.4  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130078  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0921  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.01 
 
 
260 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0860  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.7 
 
 
244 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3414  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.01 
 
 
260 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0955  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.36 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3363  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.45 
 
 
244 aa  95.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0216  phosophoadenylyl-sulfate reductase  31.69 
 
 
245 aa  95.1  7e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02591  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.86 
 
 
266 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00901  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.57 
 
 
255 aa  85.5  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.800152  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01461  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.24 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1786  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.93 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0517285  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.38 
 
 
248 aa  79  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.727681 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1445  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.24 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.86 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.54974  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.23 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3330  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  27.39 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0855113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0717  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.32 
 
 
303 aa  74.7  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.528578  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3992  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.04 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1770  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.4 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.38524e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3703  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.95 
 
 
256 aa  72  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09970  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  30.41 
 
 
241 aa  72  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00911  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.74 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.86 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1772  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  31.29 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.69 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0384  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.34 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  28.07 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.55 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.38 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.83 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0256913  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.47 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3475  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.32 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3538  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.32 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0592  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.38 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.32 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3311  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.65 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1889  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.14 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>