More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3703 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3703  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
256 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4083  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  86.27 
 
 
251 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5165  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.73 
 
 
231 aa  311  5.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.15 
 
 
248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.54974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7377  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  57.08 
 
 
246 aa  265  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833436  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2246  adenylylsulfate reductase  56.7 
 
 
241 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.445437  normal  0.0256026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1786  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  53.78 
 
 
241 aa  262  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6697  phosphoadenosine phosphosulfate  54.46 
 
 
242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2816  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  55.91 
 
 
234 aa  251  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.928214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1737  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  54.67 
 
 
239 aa  251  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14253  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1072  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  58.94 
 
 
241 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.069664  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1889  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  57.07 
 
 
260 aa  250  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4379  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  53.57 
 
 
235 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12820  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  51.74 
 
 
233 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0661  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.36 
 
 
274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.143312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3858  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.44 
 
 
232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0787584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0717  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.42 
 
 
303 aa  232  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.528578  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09970  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  51.91 
 
 
241 aa  228  8e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2772  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  48.47 
 
 
240 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.44 
 
 
231 aa  224  8e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3475  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.44 
 
 
231 aa  224  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3538  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.44 
 
 
231 aa  224  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0527  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.49 
 
 
223 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277121  normal  0.296844 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4834  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  52.47 
 
 
233 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2819  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50 
 
 
272 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000269354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6103  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.09 
 
 
223 aa  222  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12420  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.93 
 
 
254 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2685  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.39 
 
 
240 aa  215  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4821  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  48.67 
 
 
229 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3124  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  48.47 
 
 
263 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1237  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  45.61 
 
 
231 aa  204  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0431242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  45.76 
 
 
251 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3167  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  44.26 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.48 
 
 
234 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.98 
 
 
238 aa  178  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2192  phosophoadenylyl-sulfate reductase  39.72 
 
 
243 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.81 
 
 
248 aa  175  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0739  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.27 
 
 
229 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00726569  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2424  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  40.27 
 
 
234 aa  174  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.238149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1294  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.12 
 
 
235 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0413  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.32 
 
 
235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3128  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.95 
 
 
227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.377353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3868  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  38.53 
 
 
234 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  37.61 
 
 
234 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.22 
 
 
226 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.334965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.22 
 
 
226 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.44 
 
 
285 aa  158  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1476  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  37.61 
 
 
234 aa  158  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1303  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.16 
 
 
234 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.4 
 
 
268 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1582  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  37.16 
 
 
234 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.16 
 
 
234 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1344  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  37.16 
 
 
234 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1143  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.38 
 
 
234 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.536652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1544  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.16 
 
 
234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1077  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.19 
 
 
263 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1409  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.35 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.483599 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2535  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  35.09 
 
 
239 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3992  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.59 
 
 
245 aa  152  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.5 
 
 
246 aa  152  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3265  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.45 
 
 
258 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242292  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  38.74 
 
 
234 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5533  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.85 
 
 
224 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2560  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.7 
 
 
270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1642  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), adenylyl-sulfate kinase  42.7 
 
 
462 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0962  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.54 
 
 
238 aa  145  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000000110311  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.8 
 
 
249 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0665  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.2 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390577  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1168  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.2 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.206171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1015  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.2 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2346  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.2 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2939  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.2 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1660  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.2 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1008  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.2 
 
 
249 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1862  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.58 
 
 
249 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.47 
 
 
251 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0256913  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2473  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.58 
 
 
249 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0182  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.8 
 
 
252 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2478  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.58 
 
 
250 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2234  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  38.86 
 
 
269 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0822  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.4 
 
 
246 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109635  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2110  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  39.57 
 
 
240 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2522  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.2 
 
 
249 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2390  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.7 
 
 
249 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0592  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.21 
 
 
251 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2510  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  38.39 
 
 
269 aa  141  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.949973  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.47 
 
 
238 aa  141  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1147  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.91 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0816  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.91 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50151  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0176  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.3 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1777  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  41.45 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138147  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0706  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  34.84 
 
 
239 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5804  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.7 
 
 
250 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0390332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3561  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.67 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2200  Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  38.26 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.096364  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0821  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.91 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1152  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.53 
 
 
251 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0972  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.9 
 
 
248 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4056  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.53 
 
 
254 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.957521  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2694  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.78 
 
 
266 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>