More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3525 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3525  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
244 aa  502  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130078  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3363  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  92.62 
 
 
244 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0829  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  84.02 
 
 
244 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  81.97 
 
 
244 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3100  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  81.97 
 
 
244 aa  420  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.337134  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  81.97 
 
 
244 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3076  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  81.56 
 
 
244 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3141  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  81.56 
 
 
244 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.682 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3157  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  81.56 
 
 
244 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.267465 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3258  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  81.56 
 
 
244 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02607  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  79.51 
 
 
244 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0860  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  80.74 
 
 
244 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3113  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  79.1 
 
 
244 aa  411  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4016  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  79.51 
 
 
244 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.634763  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2902  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  79.1 
 
 
244 aa  411  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0812  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  80.74 
 
 
244 aa  411  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02570  hypothetical protein  79.51 
 
 
244 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0926  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.69 
 
 
244 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2890  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.28 
 
 
244 aa  407  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3064  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.69 
 
 
244 aa  408  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.696985  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0950  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.69 
 
 
244 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3225  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  80.17 
 
 
244 aa  394  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00003  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  76.05 
 
 
259 aa  380  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0216  phosophoadenylyl-sulfate reductase  71.6 
 
 
245 aa  371  1e-102  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002352  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  77.09 
 
 
259 aa  371  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000919211  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2797  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  71.85 
 
 
253 aa  357  7e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000737021  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0404  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  68.72 
 
 
253 aa  354  6.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00412674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3436  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.08 
 
 
254 aa  342  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  hitchhiker  0.0011712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.86 
 
 
248 aa  329  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0934  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  68.7 
 
 
259 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0636738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.4 
 
 
263 aa  325  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3078  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.82 
 
 
265 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0857  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.82 
 
 
265 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3736  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.46 
 
 
245 aa  319  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0894  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.4 
 
 
265 aa  318  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0946  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.56 
 
 
260 aa  318  6e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.896078  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0921  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.56 
 
 
260 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.76 
 
 
242 aa  316  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3062  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.14 
 
 
260 aa  316  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0955  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.14 
 
 
260 aa  315  6e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0655  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.71 
 
 
251 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3414  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.14 
 
 
260 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.02 
 
 
241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0667  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.14 
 
 
250 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000389799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0778  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.76 
 
 
260 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595511  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.34 
 
 
256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2114  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  63.23 
 
 
245 aa  299  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3805  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.49 
 
 
255 aa  298  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.103043 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.49 
 
 
237 aa  285  5e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0750  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.9 
 
 
237 aa  281  5.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.26 
 
 
253 aa  271  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4543  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.89 
 
 
293 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.591012 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0260  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.34 
 
 
295 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.89 
 
 
273 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.55 
 
 
232 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.45 
 
 
267 aa  211  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2865  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.8 
 
 
240 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.574909 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02591  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.84 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.2 
 
 
248 aa  178  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.727681 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00901  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.18 
 
 
255 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.800152  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01461  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.29 
 
 
256 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00911  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.16 
 
 
241 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1445  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.86 
 
 
255 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0384  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.53 
 
 
266 aa  165  5e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0084  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.77 
 
 
241 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.650501  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.67 
 
 
240 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 
240 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.09 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3311  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.89 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3330  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  32.02 
 
 
241 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0855113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.93 
 
 
241 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.64 
 
 
248 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49723  predicted protein  32.63 
 
 
264 aa  123  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0783977 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03860  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), putative  32.62 
 
 
272 aa  123  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2054  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  31.56 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.07 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2816  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  36.07 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.928214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1786  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  36.99 
 
 
241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0517285  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  35.14 
 
 
251 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2615  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  32.62 
 
 
233 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04770  Phosphoadenosine phosphosulfate reductase (EC 1.8.4.8)(PAPS reductase, thioredoxin dependent)(PAdoPS reductase)(3'-phosphoadenylylsulfate reductase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P56859]  34.11 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1077  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 
263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5165  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.04 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0962  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.51 
 
 
238 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000000110311  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12820  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  31.38 
 
 
233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  36.68 
 
 
234 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7377  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  32.88 
 
 
246 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833436  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0957  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  33.85 
 
 
220 aa  111  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.347212  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3858  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.49 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0787584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5533  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.8 
 
 
224 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.78 
 
 
268 aa  109  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.02 
 
 
231 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2246  adenylylsulfate reductase  33.79 
 
 
241 aa  108  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.445437  normal  0.0256026 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3475  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.02 
 
 
231 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3538  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.02 
 
 
231 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0717  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.41 
 
 
303 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.528578  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1669  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.91 
 
 
241 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1697  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.06 
 
 
243 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224178  normal  0.181777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0344  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  32.44 
 
 
374 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0049  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  31.05 
 
 
241 aa  106  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>