More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03587 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
248 aa  519  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  73.28 
 
 
256 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2797  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  69.51 
 
 
253 aa  340  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000737021  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3436  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.1 
 
 
254 aa  337  9e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  hitchhiker  0.0011712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  69.06 
 
 
263 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.52 
 
 
242 aa  334  7e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3736  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.11 
 
 
245 aa  332  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3078  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.67 
 
 
265 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0857  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.67 
 
 
265 aa  332  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002352  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  68.61 
 
 
259 aa  330  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000919211  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0894  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.23 
 
 
265 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3363  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  68.3 
 
 
244 aa  329  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00003  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.31 
 
 
259 aa  329  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0934  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  68.92 
 
 
259 aa  329  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0636738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3525  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.86 
 
 
244 aa  329  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130078  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4016  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.96 
 
 
244 aa  327  8e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.634763  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3062  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.9 
 
 
260 aa  327  8e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02607  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.96 
 
 
244 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02570  hypothetical protein  66.96 
 
 
244 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0667  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.57 
 
 
250 aa  326  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000389799 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3113  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.96 
 
 
244 aa  325  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0829  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.96 
 
 
244 aa  325  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2902  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.96 
 
 
244 aa  325  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3064  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.96 
 
 
244 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.696985  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0926  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.52 
 
 
244 aa  325  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518681  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0950  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.52 
 
 
244 aa  325  6e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0946  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.66 
 
 
260 aa  324  7e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.896078  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2890  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.52 
 
 
244 aa  324  8.000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3157  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.52 
 
 
244 aa  324  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.267465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3414  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.07 
 
 
260 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3258  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.52 
 
 
244 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3100  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.52 
 
 
244 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.337134  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3141  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.52 
 
 
244 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.682 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3076  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.52 
 
 
244 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0921  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.32 
 
 
260 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3225  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.07 
 
 
244 aa  320  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.96 
 
 
244 aa  319  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0955  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.83 
 
 
260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0812  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.18 
 
 
244 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.96 
 
 
244 aa  319  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0860  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.49 
 
 
244 aa  315  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0216  phosophoadenylyl-sulfate reductase  64 
 
 
245 aa  314  9.999999999999999e-85  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0655  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.96 
 
 
251 aa  310  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0778  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.78 
 
 
260 aa  309  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595511  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.77 
 
 
241 aa  306  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0404  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.33 
 
 
253 aa  306  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00412674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3805  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.89 
 
 
255 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.103043 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2114  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  60.27 
 
 
245 aa  301  9e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.54 
 
 
237 aa  297  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0750  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.54 
 
 
237 aa  293  2e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  54.22 
 
 
253 aa  287  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0260  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.79 
 
 
295 aa  248  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.34 
 
 
273 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4543  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.55 
 
 
293 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.591012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.44 
 
 
232 aa  228  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.98 
 
 
267 aa  218  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.84 
 
 
248 aa  204  8e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.727681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2865  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.09 
 
 
240 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.574909 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0384  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.18 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02591  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.88 
 
 
266 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00901  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.28 
 
 
255 aa  187  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.800152  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01461  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.44 
 
 
256 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00911  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.62 
 
 
241 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.44 
 
 
240 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1445  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.78 
 
 
255 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0084  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.5 
 
 
241 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.650501  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36 
 
 
240 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.91 
 
 
285 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3330  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  32.93 
 
 
241 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0855113 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3311  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.78 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.93 
 
 
241 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3992  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.71 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0182  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.44 
 
 
252 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  38.69 
 
 
234 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1077  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.8 
 
 
263 aa  123  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0176  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.44 
 
 
252 aa  122  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 
234 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.76 
 
 
248 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.67 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5165  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 
231 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49723  predicted protein  30.71 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0783977 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  32.9 
 
 
251 aa  118  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1395  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.89 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.4 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2777  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.96 
 
 
252 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278239  normal  0.0478398 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04770  Phosphoadenosine phosphosulfate reductase (EC 1.8.4.8)(PAPS reductase, thioredoxin dependent)(PAdoPS reductase)(3'-phosphoadenylylsulfate reductase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P56859]  32.24 
 
 
324 aa  115  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1152  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 
251 aa  115  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4056  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.85 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.957521  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2054  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  32.03 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3128  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.65 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.377353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1344  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  32.2 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1679  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  35.55 
 
 
206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.654918 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0344  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  31.56 
 
 
374 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.18 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0256913  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6978  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.11 
 
 
241 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3858  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.03 
 
 
232 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0787584 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.98 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4083  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.96 
 
 
251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2545  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  38.32 
 
 
206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6103  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.29 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  0.0209676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>