More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2837 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
242 aa  500  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0934  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  83.91 
 
 
259 aa  401  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0636738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0667  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  79.75 
 
 
250 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000389799 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0946  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  79.32 
 
 
260 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.896078  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3078  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  79.75 
 
 
265 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0857  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  79.75 
 
 
265 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3736  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.48 
 
 
245 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0955  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.48 
 
 
260 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0894  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  79.32 
 
 
265 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3062  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.9 
 
 
260 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3414  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.9 
 
 
260 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0921  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.48 
 
 
260 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.48 
 
 
263 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0655  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  75.11 
 
 
251 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0778  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  75.53 
 
 
260 aa  384  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595511  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3805  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  75.53 
 
 
255 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.103043 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2797  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.81 
 
 
253 aa  342  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000737021  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3436  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.53 
 
 
254 aa  341  5.999999999999999e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  hitchhiker  0.0011712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.52 
 
 
248 aa  334  7e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0829  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.85 
 
 
244 aa  331  5e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.11 
 
 
244 aa  331  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480804  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.11 
 
 
244 aa  331  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3363  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.69 
 
 
244 aa  331  8e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002352  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  66.37 
 
 
259 aa  328  7e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000919211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00003  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.26 
 
 
259 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0860  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.44 
 
 
244 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02607  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.6 
 
 
244 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02570  hypothetical protein  63.6 
 
 
244 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3258  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.6 
 
 
244 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0812  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.18 
 
 
244 aa  325  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3141  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.6 
 
 
244 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.682 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3100  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.6 
 
 
244 aa  324  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.337134  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4016  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.18 
 
 
244 aa  324  8.000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.634763  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3076  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.6 
 
 
244 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3113  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.18 
 
 
244 aa  323  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3157  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.18 
 
 
244 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.267465 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2902  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.18 
 
 
244 aa  323  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0216  phosophoadenylyl-sulfate reductase  62.66 
 
 
245 aa  323  2e-87  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0926  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.76 
 
 
244 aa  322  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518681  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3064  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.18 
 
 
244 aa  322  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.696985  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0950  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.76 
 
 
244 aa  322  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3225  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.08 
 
 
244 aa  322  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0404  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.02 
 
 
253 aa  322  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00412674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2890  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.76 
 
 
244 aa  321  6e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.18 
 
 
256 aa  317  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3525  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.76 
 
 
244 aa  316  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130078  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2114  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  62.61 
 
 
245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.89 
 
 
253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.56 
 
 
237 aa  288  7e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  57.87 
 
 
241 aa  287  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0750  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.56 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0260  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  54.46 
 
 
295 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  54.02 
 
 
273 aa  248  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.67 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4543  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.11 
 
 
293 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.591012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.32 
 
 
267 aa  225  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2865  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.09 
 
 
240 aa  207  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.574909 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02591  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.89 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.66 
 
 
248 aa  187  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.727681 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00901  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.44 
 
 
255 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.800152  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0384  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.08 
 
 
266 aa  177  9e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1445  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.55 
 
 
255 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01461  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.14 
 
 
256 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.29 
 
 
240 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.67 
 
 
240 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00911  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.24 
 
 
241 aa  168  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0084  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.19 
 
 
241 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.650501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3330  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  32.46 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0855113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.67 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3311  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.77 
 
 
234 aa  132  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.5 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1077  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.12 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  36.84 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.91 
 
 
248 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  35.59 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03860  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), putative  33.33 
 
 
272 aa  119  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0182  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.76 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.88 
 
 
234 aa  118  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.27 
 
 
268 aa  118  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0176  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.76 
 
 
252 aa  118  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.59 
 
 
246 aa  118  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  35.05 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2054  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  32.2 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1303  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.42 
 
 
234 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1395  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.78 
 
 
254 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.95 
 
 
249 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3868  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  35.51 
 
 
234 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1582  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  34.42 
 
 
234 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1544  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.05 
 
 
234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2424  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  32.76 
 
 
234 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.238149  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1152  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.32 
 
 
251 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1344  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  35.05 
 
 
234 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1476  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  34.58 
 
 
234 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0592  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.31 
 
 
251 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1143  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.91 
 
 
234 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.536652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0822  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.04 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109635  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3794  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  30.77 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0253672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.02 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2468  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.47 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.614171  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.55 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>