More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0404 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0404  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
253 aa  522  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00412674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00003  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  74.6 
 
 
259 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2797  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  75.73 
 
 
253 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000737021  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002352  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  78.15 
 
 
259 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000919211  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3258  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.9 
 
 
244 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3436  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.14 
 
 
254 aa  356  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  hitchhiker  0.0011712 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3076  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.9 
 
 
244 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3141  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.49 
 
 
244 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.682 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3525  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  68.72 
 
 
244 aa  354  6.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130078  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3363  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  69.14 
 
 
244 aa  353  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3100  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.49 
 
 
244 aa  352  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.337134  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3157  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.26 
 
 
244 aa  351  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.267465 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0926  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.08 
 
 
244 aa  348  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518681  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3113  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.08 
 
 
244 aa  348  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2902  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.08 
 
 
244 aa  348  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0950  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.08 
 
 
244 aa  348  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0812  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.26 
 
 
244 aa  348  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.49 
 
 
244 aa  347  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480804  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.49 
 
 
244 aa  347  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4016  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.67 
 
 
244 aa  347  7e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.634763  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3064  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.08 
 
 
244 aa  347  9e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.696985  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02607  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.67 
 
 
244 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2890  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.08 
 
 
244 aa  347  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02570  hypothetical protein  66.67 
 
 
244 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0829  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  67.08 
 
 
244 aa  345  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3225  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  68.26 
 
 
244 aa  340  9e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0860  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.61 
 
 
244 aa  334  7.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0216  phosophoadenylyl-sulfate reductase  63.52 
 
 
245 aa  329  2e-89  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0934  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.24 
 
 
259 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0636738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.58 
 
 
263 aa  322  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.02 
 
 
242 aa  322  5e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0921  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.33 
 
 
260 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0946  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.33 
 
 
260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.896078  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3078  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.55 
 
 
265 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0857  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.55 
 
 
265 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0955  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.92 
 
 
260 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3414  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.92 
 
 
260 aa  317  9e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3736  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.05 
 
 
245 aa  317  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0894  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.13 
 
 
265 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3062  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.61 
 
 
260 aa  315  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0778  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.56 
 
 
260 aa  315  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595511  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3805  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.5 
 
 
255 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.103043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0655  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.92 
 
 
251 aa  309  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0667  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.29 
 
 
250 aa  308  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000389799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.33 
 
 
248 aa  306  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.17 
 
 
256 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.7 
 
 
237 aa  281  5.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  57.59 
 
 
241 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0750  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.25 
 
 
237 aa  276  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2114  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  55.61 
 
 
245 aa  271  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  55.36 
 
 
253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0260  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.33 
 
 
295 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.92 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4543  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.15 
 
 
293 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.591012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.04 
 
 
267 aa  202  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.2 
 
 
232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2865  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.07 
 
 
240 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.574909 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02591  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.08 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.5 
 
 
248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.727681 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.53 
 
 
240 aa  171  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00901  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.48 
 
 
255 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.800152  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0384  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.46 
 
 
266 aa  167  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00911  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.91 
 
 
241 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.77 
 
 
240 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01461  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.33 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0084  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.77 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.650501  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1445  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.89 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.82 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.35 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03860  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), putative  33.61 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3330  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  30.87 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0855113 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3311  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.02 
 
 
234 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1077  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.85 
 
 
263 aa  125  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4056  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 
254 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.957521  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  34.91 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2054  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  31.25 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.29 
 
 
268 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5533  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.29 
 
 
224 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1395  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.75 
 
 
254 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.16 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1669  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.5 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400633  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.75 
 
 
241 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0962  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.91 
 
 
238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000000110311  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49723  predicted protein  31.43 
 
 
264 aa  113  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0783977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12820  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  33.04 
 
 
233 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0049  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  29.87 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0344  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  32.89 
 
 
374 aa  112  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2560  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.65 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0717  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.19 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.528578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.19 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2356  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  31.62 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  34.33 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3124  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  33.33 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6271  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1786  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  33.33 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0517285  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2468  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.21 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.614171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2246  adenylylsulfate reductase  31.96 
 
 
241 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.445437  normal  0.0256026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.43 
 
 
254 aa  108  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2772  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  31.25 
 
 
240 aa  108  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3992  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.44 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2026  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  32.31 
 
 
227 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>