More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02131 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
241 aa  497  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  75.1 
 
 
237 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0750  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  75.52 
 
 
237 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3157  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.67 
 
 
244 aa  315  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.267465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3363  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.76 
 
 
244 aa  315  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3100  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.67 
 
 
244 aa  315  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.337134  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02607  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  66.21 
 
 
244 aa  314  6e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02570  hypothetical protein  66.21 
 
 
244 aa  314  6e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3258  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.92 
 
 
244 aa  314  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3141  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.92 
 
 
244 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.682 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3076  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.29 
 
 
244 aa  313  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0926  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.75 
 
 
244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518681  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3113  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.75 
 
 
244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3525  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.02 
 
 
244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130078  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2902  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.75 
 
 
244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0950  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.75 
 
 
244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4016  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.75 
 
 
244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.634763  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3225  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.47 
 
 
244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.34 
 
 
244 aa  311  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480804  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.34 
 
 
244 aa  311  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3064  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.3 
 
 
244 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.696985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2890  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  65.3 
 
 
244 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2797  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.39 
 
 
253 aa  310  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000737021  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.77 
 
 
248 aa  306  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0216  phosophoadenylyl-sulfate reductase  60.87 
 
 
245 aa  307  1.0000000000000001e-82  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0860  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.78 
 
 
244 aa  305  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0829  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.23 
 
 
244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00003  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.5 
 
 
259 aa  304  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0812  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.41 
 
 
244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002352  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  62.5 
 
 
259 aa  302  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000919211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.68 
 
 
256 aa  297  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0667  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  63.27 
 
 
250 aa  296  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000389799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0934  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.06 
 
 
259 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0636738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.33 
 
 
263 aa  295  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3062  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.51 
 
 
260 aa  294  8e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3736  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.06 
 
 
245 aa  293  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0778  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.06 
 
 
260 aa  293  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595511  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0946  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.09 
 
 
260 aa  291  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.896078  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3414  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.09 
 
 
260 aa  291  6e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0921  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  57.68 
 
 
260 aa  290  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3078  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.62 
 
 
265 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2114  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  60.71 
 
 
245 aa  290  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0857  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.62 
 
 
265 aa  290  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3805  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.5 
 
 
255 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.103043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0655  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.06 
 
 
251 aa  288  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0894  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.18 
 
 
265 aa  288  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0955  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  57.26 
 
 
260 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  57.87 
 
 
242 aa  287  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3436  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.93 
 
 
254 aa  283  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  hitchhiker  0.0011712 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0404  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  57.59 
 
 
253 aa  280  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00412674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.82 
 
 
253 aa  239  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.74 
 
 
232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4543  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.05 
 
 
293 aa  231  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.591012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.78 
 
 
273 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0260  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.33 
 
 
295 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.56 
 
 
267 aa  215  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2865  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.67 
 
 
240 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.574909 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.87 
 
 
248 aa  192  4e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.727681 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02591  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.77 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0384  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.58 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00901  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.33 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.800152  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1445  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.91 
 
 
255 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01461  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40 
 
 
256 aa  174  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.53 
 
 
240 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00911  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.21 
 
 
241 aa  168  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0084  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.36 
 
 
241 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.650501  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.65 
 
 
240 aa  164  8e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3330  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  37.3 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0855113 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3311  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.29 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.12 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.57 
 
 
241 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.43 
 
 
285 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  39.73 
 
 
234 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0822  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.86 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109635  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1077  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.3 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1395  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.33 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2545  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  37.99 
 
 
206 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153646 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.13 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1044  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.83 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3992  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.64 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  38.74 
 
 
251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.03 
 
 
268 aa  124  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2777  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.44 
 
 
252 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278239  normal  0.0478398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5533  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.43 
 
 
224 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.02 
 
 
246 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4056  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.84 
 
 
254 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.957521  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1152  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40 
 
 
251 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0344  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  35.24 
 
 
374 aa  122  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3561  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.25 
 
 
254 aa  121  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2468  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.62 
 
 
240 aa  121  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.614171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6978  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.32 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1772  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  38.5 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4011  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.93 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1155  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.04 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.94 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.54974  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2054  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  33.33 
 
 
256 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49723  predicted protein  31.75 
 
 
264 aa  119  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0783977 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1582  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.05 
 
 
243 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356213  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4083  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.36 
 
 
251 aa  118  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3703  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.45 
 
 
256 aa  118  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>