273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3561 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3561  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
254 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  84.92 
 
 
254 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4011  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  82.68 
 
 
243 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1044  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  73.77 
 
 
244 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0822  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  76.79 
 
 
246 aa  358  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109635  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1155  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  73.68 
 
 
248 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6978  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  75.22 
 
 
241 aa  348  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1395  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.27 
 
 
254 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.12 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1077  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.18 
 
 
263 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.4 
 
 
249 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3128  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.16 
 
 
227 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.377353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3265  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.94 
 
 
258 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242292  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2560  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.22 
 
 
270 aa  221  6e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4056  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.42 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.957521  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.9 
 
 
251 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0256913  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0592  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.91 
 
 
251 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.78 
 
 
238 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0182  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0176  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.78 
 
 
268 aa  208  8e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0656  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.77 
 
 
243 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2777  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.5 
 
 
252 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278239  normal  0.0478398 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1759  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.43 
 
 
253 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1152  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.05 
 
 
251 aa  205  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3992  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.47 
 
 
245 aa  205  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0344  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  46.36 
 
 
374 aa  203  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1772  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  45.85 
 
 
237 aa  195  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2800  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.91 
 
 
227 aa  194  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0240537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1929  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  55.96 
 
 
242 aa  191  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2246  adenylylsulfate reductase  42.01 
 
 
241 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.445437  normal  0.0256026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6697  phosphoadenosine phosphosulfate  40.74 
 
 
242 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5165  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.37 
 
 
231 aa  148  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1409  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.58 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.483599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1737  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.47 
 
 
239 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14253  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7377  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  38.64 
 
 
246 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833436  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.16 
 
 
285 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2816  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  38.36 
 
 
234 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.928214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4083  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.43 
 
 
251 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1786  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  39.17 
 
 
241 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0517285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1642  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), adenylyl-sulfate kinase  40.55 
 
 
462 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  40.18 
 
 
251 aa  141  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0957  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  37.06 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.347212  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.57 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.54974  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1889  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.5 
 
 
260 aa  139  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.54 
 
 
231 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3475  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.54 
 
 
231 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3538  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.54 
 
 
231 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3703  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.67 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0661  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.22 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.143312 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12420  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.78 
 
 
254 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0717  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.67 
 
 
303 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.528578  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1072  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  36.63 
 
 
241 aa  135  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.069664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.81 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4834  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  39.71 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3167  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  36.65 
 
 
249 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12820  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  33.18 
 
 
233 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2424  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  34.58 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.238149  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09970  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  39.72 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3858  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.1 
 
 
232 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0787584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.93 
 
 
248 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2356  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  37.05 
 
 
268 aa  131  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2685  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.18 
 
 
240 aa  131  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0857  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.95 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1237  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  36.28 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0431242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0739  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.33 
 
 
229 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00726569  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4379  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  38.25 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2535  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  32.46 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6103  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.14 
 
 
223 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3317  translation initiation factor IF-2  40.31 
 
 
222 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0935287  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2772  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  33.47 
 
 
240 aa  125  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2054  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  36.52 
 
 
256 aa  125  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0527  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38 
 
 
223 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277121  normal  0.296844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3794  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  38.12 
 
 
282 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0253672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.3 
 
 
238 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  37.88 
 
 
234 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2819  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.28 
 
 
272 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000269354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3124  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  36.57 
 
 
263 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6271  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2227  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.39 
 
 
271 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2814  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.15 
 
 
266 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00991854  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4821  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  37.63 
 
 
229 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0821  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.59 
 
 
247 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0665  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.57 
 
 
249 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390577  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1168  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.57 
 
 
249 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.206171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1660  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.57 
 
 
249 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1015  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.57 
 
 
249 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2939  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.57 
 
 
249 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2346  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.57 
 
 
249 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0413  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.36 
 
 
235 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2694  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.15 
 
 
266 aa  121  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.25 
 
 
241 aa  121  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3311  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.19 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2110  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  37.89 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2390  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.1 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1862  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.1 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2473  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.1 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2200  Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  37.83 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.096364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3330  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  35.11 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0855113 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1263  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  39 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405389  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2522  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.8 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>