More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1072 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1072  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  100 
 
 
241 aa  491  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.069664  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1786  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  59.66 
 
 
241 aa  292  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0517285  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1737  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.49 
 
 
239 aa  292  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14253  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2246  adenylylsulfate reductase  64.38 
 
 
241 aa  290  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.445437  normal  0.0256026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2816  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  59.31 
 
 
234 aa  281  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.928214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7377  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  64.71 
 
 
246 aa  279  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833436  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6697  phosphoadenosine phosphosulfate  62.98 
 
 
242 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  62.75 
 
 
248 aa  277  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.54974  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1889  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  60.29 
 
 
260 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12820  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  57.85 
 
 
233 aa  267  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4379  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  57.08 
 
 
235 aa  265  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4083  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  61.54 
 
 
251 aa  264  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0717  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  57.94 
 
 
303 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.528578  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09970  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  55.7 
 
 
241 aa  255  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0661  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.54 
 
 
274 aa  253  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.143312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3703  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.94 
 
 
256 aa  251  8.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  55.45 
 
 
231 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3475  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  55.45 
 
 
231 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3538  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  55.45 
 
 
231 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3858  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  55.76 
 
 
232 aa  248  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0787584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5165  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.1 
 
 
231 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2685  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.6 
 
 
240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2772  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  53.33 
 
 
240 aa  238  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1237  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  55.71 
 
 
231 aa  234  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0431242  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12420  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.85 
 
 
254 aa  230  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2819  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  54.37 
 
 
272 aa  229  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000269354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3124  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  53.4 
 
 
263 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6271  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3167  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  53.08 
 
 
249 aa  224  9e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0527  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  54.41 
 
 
223 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277121  normal  0.296844 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4834  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  53.14 
 
 
233 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6103  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.47 
 
 
223 aa  211  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4821  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  50.97 
 
 
229 aa  205  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2424  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  49.22 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.238149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0739  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.67 
 
 
229 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00726569  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1344  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  43.06 
 
 
234 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  41.63 
 
 
234 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3868  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  43.72 
 
 
234 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.55 
 
 
248 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1476  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  42.79 
 
 
234 aa  184  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1582  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  41.2 
 
 
234 aa  184  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1544  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.63 
 
 
234 aa  184  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1303  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.2 
 
 
234 aa  184  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  47.12 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.59 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.79 
 
 
234 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.93 
 
 
234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1294  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.45 
 
 
235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1143  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.86 
 
 
234 aa  182  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.536652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.86 
 
 
226 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.334965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.86 
 
 
226 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2192  phosophoadenylyl-sulfate reductase  41.28 
 
 
243 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.18 
 
 
268 aa  176  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0413  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.6 
 
 
235 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2110  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  45.26 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3992  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.84 
 
 
245 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3128  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.95 
 
 
227 aa  169  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.377353 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2560  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.96 
 
 
270 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1759  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.98 
 
 
253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1642  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), adenylyl-sulfate kinase  46.11 
 
 
462 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  44.15 
 
 
234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5533  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.6 
 
 
224 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2200  Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  44.16 
 
 
239 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.096364  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1395  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.92 
 
 
254 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1409  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.86 
 
 
239 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.483599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3265  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.9 
 
 
258 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242292  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.33 
 
 
246 aa  155  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0182  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.08 
 
 
252 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0176  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.67 
 
 
252 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2478  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.73 
 
 
250 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1862  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.73 
 
 
249 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.76 
 
 
285 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2473  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.73 
 
 
249 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.08 
 
 
249 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1077  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.58 
 
 
263 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3662  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.68 
 
 
248 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2356  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  42.99 
 
 
268 aa  148  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1152  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.71 
 
 
251 aa  148  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0957  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  40.76 
 
 
220 aa  148  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.347212  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0972  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.76 
 
 
248 aa  148  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0962  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.13 
 
 
238 aa  148  9e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000000110311  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3317  translation initiation factor IF-2  43.2 
 
 
222 aa  148  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0935287  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2522  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.32 
 
 
249 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0822  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109635  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2233  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.68 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.1 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0256913  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2054  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  42.52 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2390  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.32 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5804  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.32 
 
 
250 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0390332 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2800  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.81 
 
 
227 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0240537  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0656  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.08 
 
 
243 aa  145  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0592  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.68 
 
 
251 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1786  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  41.09 
 
 
275 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0527407 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0665  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.71 
 
 
249 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390577  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1168  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.71 
 
 
249 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.206171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2939  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.71 
 
 
249 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2346  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.71 
 
 
249 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1660  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.71 
 
 
249 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1015  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.71 
 
 
249 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0821  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.08 
 
 
247 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.07 
 
 
254 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>