More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3128 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3128  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
227 aa  455  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.377353 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2560  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  55.36 
 
 
270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4056  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  57.53 
 
 
254 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.957521  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0191  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.48 
 
 
249 aa  241  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  54.3 
 
 
268 aa  241  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.37 
 
 
246 aa  241  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0182  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.48 
 
 
252 aa  237  9e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0176  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.48 
 
 
252 aa  236  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2800  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  55.56 
 
 
227 aa  232  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0240537  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3992  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.63 
 
 
245 aa  231  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1395  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.81 
 
 
254 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1077  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.62 
 
 
263 aa  228  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.83 
 
 
238 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1152  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  54.25 
 
 
251 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0592  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.08 
 
 
251 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.36 
 
 
251 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0256913  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3561  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.16 
 
 
254 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1759  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.62 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.29 
 
 
254 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0656  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50 
 
 
243 aa  218  7.999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4011  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.65 
 
 
243 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3265  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.63 
 
 
258 aa  215  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242292  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0822  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  55.61 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6978  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.12 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2777  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.08 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278239  normal  0.0478398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1044  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.36 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1155  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.83 
 
 
248 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0344  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  51.46 
 
 
374 aa  209  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1772  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  52.04 
 
 
237 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1929  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.54 
 
 
242 aa  202  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2246  adenylylsulfate reductase  46.05 
 
 
241 aa  178  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.445437  normal  0.0256026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6697  phosphoadenosine phosphosulfate  47.74 
 
 
242 aa  177  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09970  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  51.61 
 
 
241 aa  175  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4083  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.61 
 
 
251 aa  174  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5165  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.21 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0661  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.19 
 
 
274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.143312 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.46 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.54974  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1889  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.99 
 
 
260 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1737  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.24 
 
 
239 aa  171  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14253  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0957  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  39.29 
 
 
220 aa  169  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.347212  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1072  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  44.95 
 
 
241 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.069664  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0717  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.2 
 
 
303 aa  167  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.528578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2816  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  47.59 
 
 
234 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.928214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1642  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), adenylyl-sulfate kinase  43.66 
 
 
462 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1786  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  44.25 
 
 
241 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0517285  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3124  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  48.37 
 
 
263 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6271  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2424  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  41.84 
 
 
234 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.238149  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12820  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  46.15 
 
 
233 aa  164  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7377  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  44.78 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833436  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2819  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.37 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000269354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3858  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.15 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0787584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3703  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.95 
 
 
256 aa  162  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4379  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  45.6 
 
 
235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.33 
 
 
231 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3475  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.33 
 
 
231 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3538  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.33 
 
 
231 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12420  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.24 
 
 
254 aa  159  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2685  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.22 
 
 
240 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.41 
 
 
234 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1409  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.72 
 
 
239 aa  155  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.483599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1237  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  43.84 
 
 
231 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0431242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  40.61 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.35 
 
 
238 aa  151  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.63 
 
 
285 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2192  phosophoadenylyl-sulfate reductase  35.81 
 
 
243 aa  149  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.09 
 
 
234 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2772  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  40 
 
 
240 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0739  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.81 
 
 
229 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00726569  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1143  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.58 
 
 
234 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.536652  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4821  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  45.16 
 
 
229 aa  148  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  40.62 
 
 
234 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1544  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40 
 
 
234 aa  148  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1303  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.38 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1294  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.45 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3868  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  39.47 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3317  translation initiation factor IF-2  45.23 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0935287  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1582  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  39.58 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1476  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  38.42 
 
 
234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4834  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  41.2 
 
 
233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.1 
 
 
226 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.334965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.1 
 
 
226 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1263  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  38.89 
 
 
245 aa  145  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405389  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.51 
 
 
248 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0527  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.4 
 
 
223 aa  145  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277121  normal  0.296844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6103  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.72 
 
 
223 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3662  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.46 
 
 
248 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1344  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  38.22 
 
 
234 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0972  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.72 
 
 
248 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0413  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.38 
 
 
235 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2390  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.38 
 
 
249 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  39.2 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3167  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  43.6 
 
 
249 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2110  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  43.78 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2814  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.79 
 
 
266 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00991854  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2522  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.42 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1777  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  39.83 
 
 
238 aa  138  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2478  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.66 
 
 
250 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0821  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.49 
 
 
247 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.49 
 
 
241 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2473  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.66 
 
 
249 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>