77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0488 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
319 aa  663    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.9 
 
 
334 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1365  gp51  44.65 
 
 
373 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.36 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0136042  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1030  gp57  42.31 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818193  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.47 
 
 
363 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3838  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.12 
 
 
408 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0614264  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.71 
 
 
430 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0220762  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  30.08 
 
 
594 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  28.39 
 
 
588 aa  77  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  27.97 
 
 
592 aa  72.4  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0336  hypothetical protein  28.24 
 
 
341 aa  72.4  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  28 
 
 
472 aa  72  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  29.24 
 
 
594 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0006  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  24.83 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000392553  hitchhiker  0.000000249186 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5329  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.02 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.176217 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.88 
 
 
284 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2724  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.62 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.548839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26 
 
 
276 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5004  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.53 
 
 
346 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  0.549509 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  25.61 
 
 
428 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  25.5 
 
 
509 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0637  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.35 
 
 
270 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.899373  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  24.11 
 
 
512 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0627  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  28.99 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0745757  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  27.5 
 
 
469 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1301  hypothetical protein  26.41 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  25.69 
 
 
466 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  24.05 
 
 
428 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  23.11 
 
 
503 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  27.35 
 
 
633 aa  57  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  25.1 
 
 
441 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  22.98 
 
 
428 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  22.36 
 
 
428 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  24.24 
 
 
491 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  24.89 
 
 
614 aa  56.2  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  23.72 
 
 
502 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.89 
 
 
278 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  26.09 
 
 
464 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.97 
 
 
784 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.23 
 
 
580 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.4 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  25.43 
 
 
634 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.3 
 
 
298 aa  53.5  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.69 
 
 
257 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.1 
 
 
421 aa  52.8  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2615  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  35.8 
 
 
233 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  26.38 
 
 
878 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1697  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.57 
 
 
243 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224178  normal  0.181777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4654  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  37.14 
 
 
252 aa  49.3  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550549  hitchhiker  0.00181688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  24.9 
 
 
469 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3011  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.56 
 
 
368 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4046  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.85 
 
 
368 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  25.98 
 
 
667 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.11 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  25 
 
 
588 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3868  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  23.53 
 
 
234 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1476  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  22.99 
 
 
234 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4126  hypothetical protein  30.23 
 
 
213 aa  46.2  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.62 
 
 
885 aa  45.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1582  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  24.6 
 
 
234 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.6 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1303  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.6 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  24.49 
 
 
880 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4322  hypothetical protein  27.52 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2423  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.81 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1544  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.99 
 
 
234 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  22.99 
 
 
234 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2687  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.45 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.966283  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2227  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.85 
 
 
271 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3393  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.32 
 
 
273 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  30.86 
 
 
251 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0717  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.58 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.528578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0623  IbrA protein  24.43 
 
 
406 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2772  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  31.19 
 
 
240 aa  42.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3041  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.43 
 
 
406 aa  42.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0654  IbrA protein  24.43 
 
 
406 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.533054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>