27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1301 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1301  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  706    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0336  hypothetical protein  53.82 
 
 		 341 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5004  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.52 
 
 		 346 aa  358  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  0.549509 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4322  hypothetical protein  51.55 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2724  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.15 
 
 		 387 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.548839 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0006  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  45.14 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000392553  hitchhiker  0.000000249186 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4126  hypothetical protein  45.79 
 
 		 213 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4117  hypothetical protein  49.28 
 
 		 165 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3838  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.93 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0614264  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.81 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0136042  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.41 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.36 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.83 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.37 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0220762  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.33 
 
 		 784 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  21.37 
 
 		 428 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  21.05 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5428  hypothetical protein  25.87 
 
 		 404 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  20.72 
 
 		 428 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  19.88 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  31.36 
 
 		 594 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1030  gp57  28.15 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818193  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  28.9 
 
 		 507 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  36.14 
 
 		 566 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  21.67 
 
 		 441 aa  42.7  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  22.45 
 
 		 796 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>