More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2943 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  100 
 
 		 796 aa  1632    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  53.25 
 
 		 667 aa  742    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  33.53 
 
 		 633 aa  350  8e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  31.29 
 
 		 634 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.75 
 
 		 580 aa  296  9e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.58 
 
 		 885 aa  290  6e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  34.55 
 
 		 880 aa  289  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  33.93 
 
 		 878 aa  281  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  33.2 
 
 		 879 aa  272  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  34.06 
 
 		 896 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  29.65 
 
 		 614 aa  258  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 428 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  32.85 
 
 		 428 aa  250  6e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  32.85 
 
 		 428 aa  245  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.27 
 
 		 421 aa  244  5e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  32.43 
 
 		 428 aa  244  6e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  32.27 
 
 		 441 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  29.27 
 
 		 469 aa  232  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  30.01 
 
 		 594 aa  228  2e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  30.24 
 
 		 512 aa  228  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  29.96 
 
 		 472 aa  228  4e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  28.21 
 
 		 509 aa  226  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  28.61 
 
 		 594 aa  223  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  31.25 
 
 		 502 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  30.57 
 
 		 491 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  29.51 
 
 		 592 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  29.54 
 
 		 469 aa  212  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  30.44 
 
 		 503 aa  209  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  28.46 
 
 		 588 aa  206  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  27.76 
 
 		 466 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  27.88 
 
 		 464 aa  198  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.87 
 
 		 723 aa  119  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0799  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.85 
 
 		 755 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.39 
 
 		 784 aa  107  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.07 
 
 		 238 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1789  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  31.38 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000854791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0739  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.5 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00726569  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2424  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  28.43 
 
 		 234 aa  72.4  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.238149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1567  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.79 
 
 		 224 aa  68.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.779448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1777  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  28.99 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.05 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.57 
 
 		 220 aa  66.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1544  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.44 
 
 		 234 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1765  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.84 
 
 		 226 aa  66.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1303  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.72 
 
 		 234 aa  65.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  29.44 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1582  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  28.72 
 
 		 234 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138804  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.38 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.334965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.38 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1476  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  28.72 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.21 
 
 		 234 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3868  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  28.72 
 
 		 234 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1344  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.08 
 
 		 234 aa  63.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5533  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.3 
 
 		 224 aa  63.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1769  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.64 
 
 		 244 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000122122 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1143  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.86 
 
 		 234 aa  62  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.536652  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5329  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.61 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.176217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2280  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.15 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0503527  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2328  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.64 
 
 		 244 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000480323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3442  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.64 
 
 		 244 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0646773  hitchhiker  0.00239136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1929  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.64 
 
 		 244 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0556213  hitchhiker  0.0000000000165041 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.81 
 
 		 248 aa  59.7  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2429  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25.53 
 
 		 264 aa  59.3  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.149662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1294  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.32 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  25.5 
 
 		 538 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  32.68 
 
 		 597 aa  58.5  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.35 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0485468 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0706  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.07 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1702  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.14 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2290  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.93 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.85 
 
 		 378 aa  57  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.91 
 
 		 278 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1300  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.23 
 
 		 227 aa  56.2  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.88984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3551  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.71 
 
 		 244 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1147  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.24 
 
 		 256 aa  57  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2800  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.52 
 
 		 227 aa  56.2  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0240537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0828  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.29 
 
 		 312 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1582  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.91 
 
 		 243 aa  56.6  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356213  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2969  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.55 
 
 		 244 aa  56.2  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  decreased coverage  0.00395562 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0413  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.5 
 
 		 235 aa  55.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12894  predicted protein  22.46 
 
 		 403 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.894493  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2192  phosophoadenylyl-sulfate reductase  27.32 
 
 		 243 aa  55.8  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2078  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.4 
 
 		 244 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.634156  hitchhiker  0.00442087 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  30 
 
 		 677 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1409  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.06 
 
 		 239 aa  55.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.483599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0796  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.27 
 
 		 256 aa  55.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41840  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.75 
 
 		 267 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  25.94 
 
 		 551 aa  54.7  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  35.63 
 
 		 617 aa  54.3  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0173  putative phage-related protein  26.48 
 
 		 280 aa  54.3  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000630983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1182  putative phage-related protein  26.48 
 
 		 280 aa  54.3  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.225996  normal  0.11373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.42 
 
 		 244 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23150  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.5 
 
 		 244 aa  53.9  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3153  immunoglobulin-binding regulator A  28.17 
 
 		 408 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1263  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  26.24 
 
 		 245 aa  53.9  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  25.1 
 
 		 566 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0194  coenzyme F420-reducing hydrogenase, gamma subunit  40 
 
 		 228 aa  53.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.33 
 
 		 276 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  47.17 
 
 		 597 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2337  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  27.04 
 
 		 261 aa  53.5  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.7616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>