22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2724 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013930  TK90_2724  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
387 aa  805    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.548839 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0006  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  64.92 
 
 
327 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000392553  hitchhiker  0.000000249186 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1301  hypothetical protein  50.15 
 
 
339 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5004  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.91 
 
 
346 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  0.549509 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0336  hypothetical protein  44.41 
 
 
341 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4322  hypothetical protein  44.44 
 
 
348 aa  259  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4126  hypothetical protein  44.86 
 
 
213 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4117  hypothetical protein  43.17 
 
 
165 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.62 
 
 
319 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.49 
 
 
284 aa  46.6  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  23.45 
 
 
428 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.33 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  24.67 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1365  gp51  32.53 
 
 
373 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  26.67 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  26.53 
 
 
528 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.2 
 
 
430 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0220762  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.91 
 
 
334 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3838  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.76 
 
 
408 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0614264  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.76 
 
 
336 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0136042  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  29.41 
 
 
507 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  22.57 
 
 
428 aa  43.1  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>