157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0891 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 		 334 aa  696    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  78.98 
 
 		 336 aa  568  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0136042  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3838  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  80.34 
 
 		 408 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0614264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.94 
 
 		 363 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.9 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1030  gp57  43.02 
 
 		 332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818193  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1365  gp51  43.03 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.57 
 
 		 430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0220762  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  26.48 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.49 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  26.09 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  27.64 
 
 		 879 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  26.19 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  26.07 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  26.16 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.63 
 
 		 885 aa  63.2  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  26.34 
 
 		 594 aa  62.8  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0006  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  26.42 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000392553  hitchhiker  0.000000249186 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  27.04 
 
 		 441 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  26.16 
 
 		 594 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  24.38 
 
 		 588 aa  60.8  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1301  hypothetical protein  30.36 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.36 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  24.05 
 
 		 592 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0717  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.5 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.528578  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  26.38 
 
 		 880 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1226  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  45.83 
 
 		 234 aa  57  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0928786  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4654  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  36.9 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550549  hitchhiker  0.00181688 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.13 
 
 		 421 aa  57  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  27.27 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  27.02 
 
 		 878 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4322  hypothetical protein  24.26 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.4 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5004  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.73 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  0.549509 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0336  hypothetical protein  31.68 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2423  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.17 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1147  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.61 
 
 		 256 aa  53.9  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1697  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.52 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224178  normal  0.181777 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0661  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.11 
 
 		 274 aa  53.5  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.143312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7377  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  34.41 
 
 		 246 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2615  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.33 
 
 		 233 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2390  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.12 
 
 		 249 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2814  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.15 
 
 		 266 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00991854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2522  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.12 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2110  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  34.78 
 
 		 240 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2478  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.12 
 
 		 250 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1862  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.12 
 
 		 249 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2473  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.12 
 
 		 249 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.51 
 
 		 279 aa  52.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  25.29 
 
 		 512 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25 
 
 		 257 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  25.31 
 
 		 633 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  25.29 
 
 		 503 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.88 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5804  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.5 
 
 		 250 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0390332 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0816  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.7 
 
 		 249 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50151  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  32.29 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  25.6 
 
 		 469 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1237  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  38.75 
 
 		 231 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0431242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2560  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.69 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.32 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1567  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.38 
 
 		 224 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.779448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0821  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.5 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2227  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.59 
 
 		 271 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  26.53 
 
 		 502 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1072  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  29.51 
 
 		 241 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.069664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2200  Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  31.52 
 
 		 239 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.096364  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0665  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.61 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390577  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2687  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.59 
 
 		 267 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.966283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1168  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.61 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.206171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2346  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.61 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2939  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.61 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1008  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.61 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1015  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.61 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1660  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.61 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0637  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.1 
 
 		 270 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.899373  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0559  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  31.86 
 
 		 258 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.639085  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2233  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.32 
 
 		 246 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0882  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  35.37 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12820  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  40.58 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0527  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.79 
 
 		 223 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277121  normal  0.296844 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1777  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  35.82 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138147  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  25 
 
 		 509 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1801  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  35.37 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803046  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2694  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.73 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2246  adenylylsulfate reductase  28.66 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.445437  normal  0.0256026 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  25.47 
 
 		 466 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0972  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.25 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1669  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.4 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1118  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.93 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.03 
 
 		 580 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1501  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  32.61 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5481  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  35.37 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2356  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  31.25 
 
 		 268 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2685  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.21 
 
 		 240 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2772  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  31.25 
 
 		 240 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2234  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  35.71 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3662  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.25 
 
 		 248 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>