62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0637 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0637  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 		 270 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.899373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.3 
 
 		 278 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.24 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.73 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5329  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.93 
 
 		 278 aa  209  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.176217 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.49 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.45 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0173  putative phage-related protein  40.89 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000630983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1182  putative phage-related protein  40.89 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.225996  normal  0.11373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4046  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.12 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3011  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.93 
 
 		 368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11209  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00122  putative phage-related protein  34.57 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  25.1 
 
 		 512 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  25.53 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.35 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  25.28 
 
 		 491 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  24.71 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  23.45 
 
 		 667 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.05 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  25.2 
 
 		 469 aa  59.7  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  28.9 
 
 		 878 aa  59.7  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  23.92 
 
 		 503 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  24.54 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  24.79 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  23.71 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.86 
 
 		 885 aa  56.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4093  hypothetical protein  27.23 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0520376  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.32 
 
 		 580 aa  55.8  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  23.95 
 
 		 509 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  22.42 
 
 		 588 aa  54.7  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1365  gp51  26.77 
 
 		 373 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8682  hypothetical protein  25.27 
 
 		 288 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  24.27 
 
 		 634 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4218  hypothetical protein  24.64 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.19 
 
 		 363 aa  52.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  21.7 
 
 		 441 aa  52.4  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  21.88 
 
 		 592 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.1 
 
 		 334 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  22.88 
 
 		 594 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  22.37 
 
 		 594 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  24.6 
 
 		 633 aa  48.9  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  31.78 
 
 		 464 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1030  gp57  26.3 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818193  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0799  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.75 
 
 		 755 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.35 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0136042  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  25.94 
 
 		 896 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.85 
 
 		 335 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  24.51 
 
 		 472 aa  46.2  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0249  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.44 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.819659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  24.15 
 
 		 880 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  23.14 
 
 		 879 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1652  hypothetical protein  30.71 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2827  hypothetical protein  23.7 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.556996 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0153  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.68 
 
 		 353 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327935  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  28.06 
 
 		 391 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1211  putative phage-related protein  29.2 
 
 		 280 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  22.27 
 
 		 466 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3838  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.62 
 
 		 408 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0614264  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.07 
 
 		 392 aa  42.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  23.02 
 
 		 469 aa  42.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  20.32 
 
 		 796 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>