More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2060 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  100 
 
 
594 aa  1204    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  74.41 
 
 
588 aa  892    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  76.09 
 
 
594 aa  924    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  70.78 
 
 
592 aa  900    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  37.82 
 
 
614 aa  391  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  31.51 
 
 
633 aa  281  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.1 
 
 
580 aa  280  4e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  31.19 
 
 
634 aa  279  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  31.97 
 
 
509 aa  246  6e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  31.83 
 
 
512 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  34.54 
 
 
469 aa  242  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  30.48 
 
 
667 aa  238  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  31.28 
 
 
491 aa  238  2e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  34.27 
 
 
472 aa  238  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  34.71 
 
 
469 aa  236  7e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  32.44 
 
 
503 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  31.75 
 
 
466 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  31.61 
 
 
502 aa  231  4e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  28.61 
 
 
796 aa  223  8e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  32.97 
 
 
464 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.04 
 
 
885 aa  196  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  33.04 
 
 
878 aa  193  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  29.91 
 
 
879 aa  190  7e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  32.02 
 
 
896 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  29.57 
 
 
428 aa  177  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  30.08 
 
 
880 aa  171  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  28.72 
 
 
428 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  28.72 
 
 
428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  28.08 
 
 
428 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  27.63 
 
 
441 aa  159  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.36 
 
 
784 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.23 
 
 
421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.56 
 
 
723 aa  137  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0799  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.91 
 
 
755 aa  134  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0739  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.85 
 
 
229 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00726569  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.84 
 
 
238 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.98 
 
 
248 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5533  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30 
 
 
224 aa  84  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2192  phosophoadenylyl-sulfate reductase  28.43 
 
 
243 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2290  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.04 
 
 
237 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.43 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.334965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.43 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1263  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  29.36 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405389  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0706  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  26.29 
 
 
239 aa  79  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1294  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.02 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1544  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.94 
 
 
234 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0796  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.98 
 
 
256 aa  76.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0413  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.87 
 
 
235 aa  76.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  27.94 
 
 
234 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1303  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.45 
 
 
234 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3868  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  27.94 
 
 
234 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1582  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  27.45 
 
 
234 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1344  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.45 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.45 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.89 
 
 
234 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1777  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  28.64 
 
 
238 aa  73.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1476  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  27.45 
 
 
234 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1669  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.06 
 
 
241 aa  73.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400633  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1143  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.57 
 
 
234 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.536652  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1300  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.08 
 
 
227 aa  73.6  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.88984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2280  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.96 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0503527  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0962  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.23 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000000110311  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3551  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.85 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1863  Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25.26 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1582  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.87 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.24 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2110  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  29.17 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1147  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.14 
 
 
256 aa  70.1  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1567  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.41 
 
 
224 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.779448  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2468  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.05 
 
 
240 aa  69.3  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.614171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  28.21 
 
 
551 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41840  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.24 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.67 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2337  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  27.46 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1697  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.98 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224178  normal  0.181777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2354  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.21 
 
 
230 aa  67  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0700983  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0049  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  22.39 
 
 
241 aa  67  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1716  phosphoadenosine phosphosulfate reductase, putative  25.76 
 
 
235 aa  67  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1561  adenylylsulfate reductase thioredoxin dependent  28.64 
 
 
250 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3393  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.45 
 
 
273 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1501  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  27.72 
 
 
249 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178392  normal  0.54749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2969  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.65 
 
 
244 aa  66.6  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  decreased coverage  0.00395562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1770  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.04 
 
 
236 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.38524e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2535  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  25.12 
 
 
239 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13445  APS reductase  27.88 
 
 
415 aa  65.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  26.42 
 
 
588 aa  65.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2858  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  24.74 
 
 
235 aa  64.7  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0023107  hitchhiker  0.0000184326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2615  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27 
 
 
233 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3935  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.46 
 
 
231 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2054  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  26.89 
 
 
256 aa  64.7  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1226  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  26.29 
 
 
234 aa  63.9  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0928786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2424  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.27 
 
 
234 aa  63.9  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.238149  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2429  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  27.59 
 
 
264 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.149662  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2078  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.01 
 
 
244 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.634156  hitchhiker  0.00442087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23150  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.89 
 
 
244 aa  63.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.71 
 
 
244 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1769  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.46 
 
 
244 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000122122 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  26.38 
 
 
538 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0972  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.5 
 
 
248 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2786  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.14 
 
 
244 aa  63.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>