21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4322 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4322  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  736    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5004  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  54.24 
 
 		 346 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  0.549509 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0336  hypothetical protein  52.16 
 
 		 341 aa  353  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1301  hypothetical protein  51.55 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2724  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.44 
 
 		 387 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.548839 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0006  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  42.11 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000392553  hitchhiker  0.000000249186 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4126  hypothetical protein  46.88 
 
 		 213 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4117  hypothetical protein  44.78 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.84 
 
 		 284 aa  57  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.52 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0136042  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.26 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3838  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.57 
 
 		 408 aa  53.1  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0614264  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.2 
 
 		 430 aa  50.4  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0220762  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  22.67 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  26.69 
 
 		 528 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  22.27 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  21.69 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  21.86 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.52 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  23.83 
 
 		 614 aa  43.9  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3794  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  33.33 
 
 		 282 aa  43.5  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0253672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>