66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2091 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 		 298 aa  619  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.64 
 
 		 279 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1182  putative phage-related protein  44.18 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.225996  normal  0.11373 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0173  putative phage-related protein  44.18 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000630983 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00122  putative phage-related protein  40.34 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.61 
 
 		 276 aa  212  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.8 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.11 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5329  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.8 
 
 		 278 aa  202  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.176217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0637  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.45 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.899373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4046  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.83 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3011  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.42 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11209  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  25.4 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  27.18 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  27.4 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.49 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.35 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0136042  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  27.54 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1365  gp51  25.28 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  25.24 
 
 		 428 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4218  hypothetical protein  25.11 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  26.27 
 
 		 667 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4093  hypothetical protein  24.12 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0520376  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0249  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.39 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.819659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  33.06 
 
 		 509 aa  54.3  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.11 
 
 		 421 aa  53.1  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.3 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  27.01 
 
 		 469 aa  52.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  29.77 
 
 		 592 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  26.22 
 
 		 466 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  26.67 
 
 		 634 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0799  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.6 
 
 		 755 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0627  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  29.33 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0745757  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2431  putative phage-related protein  26.62 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  28.1 
 
 		 588 aa  50.8  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  27.96 
 
 		 594 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  30.77 
 
 		 469 aa  49.3  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.64 
 
 		 580 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.84 
 
 		 784 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.86 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1211  putative phage-related protein  23.43 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  25.49 
 
 		 551 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  24.84 
 
 		 588 aa  46.6  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  32.41 
 
 		 633 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1652  hypothetical protein  23.85 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.87 
 
 		 284 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2827  hypothetical protein  21.83 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.556996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  26.24 
 
 		 391 aa  46.2  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.25 
 
 		 723 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  27.65 
 
 		 502 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1030  gp57  22.03 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818193  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3838  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.79 
 
 		 408 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0614264  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.93 
 
 		 885 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  31.82 
 
 		 464 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  26.01 
 
 		 878 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8682  hypothetical protein  24.36 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0661  hypothetical protein  22.5 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.674805 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  23.08 
 
 		 796 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  25.94 
 
 		 594 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  29.7 
 
 		 880 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  25.55 
 
 		 522 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  32.35 
 
 		 879 aa  43.1  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.57 
 
 		 342 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  25.71 
 
 		 538 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.38 
 
 		 248 aa  42.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  23.88 
 
 		 495 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>