50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1182 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0173  putative phage-related protein  100 
 
 		 280 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000630983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1182  putative phage-related protein  100 
 
 		 280 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.225996  normal  0.11373 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  71.79 
 
 		 279 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.35 
 
 		 276 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.29 
 
 		 278 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.18 
 
 		 298 aa  244  9e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5329  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.1 
 
 		 278 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.176217 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  49.77 
 
 		 257 aa  211  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0637  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.89 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.899373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4046  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.85 
 
 		 368 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3011  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.95 
 
 		 368 aa  135  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11209  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00122  putative phage-related protein  41.29 
 
 		 350 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  25.7 
 
 		 428 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  24.5 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  24.4 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  22.8 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.9 
 
 		 421 aa  55.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  26.48 
 
 		 796 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  31.21 
 
 		 495 aa  52.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  30.14 
 
 		 588 aa  52.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.88 
 
 		 336 aa  52.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0136042  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2431  putative phage-related protein  23.32 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  27.92 
 
 		 592 aa  52  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1365  gp51  25.46 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  25.12 
 
 		 667 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  32.26 
 
 		 544 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.5 
 
 		 885 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.63 
 
 		 580 aa  48.9  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  27.89 
 
 		 878 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4093  hypothetical protein  24.58 
 
 		 322 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0520376  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  24 
 
 		 634 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  22.61 
 
 		 441 aa  47  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.9 
 
 		 334 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.35 
 
 		 723 aa  46.2  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  24.91 
 
 		 896 aa  46.2  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  27.7 
 
 		 391 aa  45.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0627  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  27.21 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0745757  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  23.98 
 
 		 469 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.68 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  28.21 
 
 		 466 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  24.15 
 
 		 588 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  26.87 
 
 		 594 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  24.42 
 
 		 509 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8682  hypothetical protein  25 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4218  hypothetical protein  27.35 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  25 
 
 		 512 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  25.93 
 
 		 633 aa  42.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  26.35 
 
 		 551 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  28.77 
 
 		 538 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.31 
 
 		 284 aa  42  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>